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结合和不结合 DNA 的 Sau3AI 的晶体结构表明基于自激活的 DNA 切割机制
Structure ( IF 4.3 ) Pub Date : 2023-08-30 , DOI: 10.1016/j.str.2023.08.005
Yahui Liu 1 , Chunyan Xu 2 , Huan Zhou 2 , Weiwei Wang 2 , Bing Liu 3 , Yan Li 4 , Xiaojian Hu 5 , Feng Yu 2 , Jianhua He 6
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II 型限制性内切酶 Sau3AI 切割双链 DNA 中的序列 5'-GATC-3',产生两个粘性末端。无论甲基化状态如何,Sau3AI 都会切割两条 DNA 链。在这里,我们报告了活性位点突变体 Sau3AI-E64A 和结合 GATC 底物的 C 端结构域 Sau3AI-C 的晶体结构。有趣的是,N 端结构域 (Sau3AI-N) 的催化位点在空间上被 C 端结构域阻断,表明该酶具有潜在的自我抑制作用。中断 Sau3AI-C 与底物 DNA 的结合会破坏 Sau3AI 的功能,表明 N 端和 C 端结构域之间存在功能性联系。我们认为Sau3AI-C作为一种变构效应子结合一种GATC底物,触发构象变化以打开N端催化位点,导致随后的GATC被Sau3AI-N识别并切割第二个GATC位点。我们的数据表明 Sau3AI 和 UbaLAI 可能代表 IIE 型限制性酶的新亚类。

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