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毛果杨二酰甘油激酶 (DGK) 基因家族的全基因组鉴定和表征
Physiological and Molecular Plant Pathology ( IF 2.8 ) Pub Date : 2023-08-14 , DOI: 10.1016/j.pmpp.2023.102121
Hongyu Wang , Zhongfu Yan , Minsheng Yang , Lijiao Gu

二酰甘油激酶 (DGK) 是一种将二酰甘油转化为磷脂酸的酶,在植物生物和非生物胁迫反应中发挥着关键作用。尽管毛果杨基因组已被测序,但PtDGK基因家族的特征尚未见报道。在本研究中,我们对杨树中的PtDGK基因家族进行了全基因组研究和表达模式分析。总共 7 个PtDGK基因 ( PtDGK1 - PtDGK7)被识别并分为三个簇,即簇 I (3)、簇 II (2) 和簇 III (2)。序列分析显示,所有成员均含有两个保守结构域DAGKa和DAGKc,而Cluster I含有两个额外的DAG/PE结合结构域,并且在蛋白质三维结构上更加保守。此外,三个PtDGK亚家族的成员具有相似的基因结构、基序组成和保守结构域。染色体定位显示,7个PtDGK成员位于7条不同的染色体上,每条染色体仅包含1个PtDGK成员。毛果杨中发现两个节段重复基因对,在进化过程中经历了纯化选择。共线性分析表明,毛果杨与拟南芥的共线性基因对多于与葡萄的共线性基因对。启动子区域富含激素和应激反应式作用元件。RNA-seq转录组数据揭示了PtDGK在不同组织和各种激素处理(水杨酸和茉莉酸)、非生物胁迫(盐、干旱、冷和热)和生物胁迫(害虫和病原体)下的不同表达模式。实时定量PCR分析表明DGK3DGK5可以通过盐处理来诱导。这项工作首次描述了杨树中PtDGK的特征,并表明了它们在生物和非生物胁迫中的重要性,这将为未来对PtDGK的理解和功能解剖的进一步研究提供指导。





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更新日期:2023-08-19
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