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转录组分析揭示了杏(Armeniaca vulgaris Lam.)及其幼苗果实外观不同的机制
Molecular Biology Reports ( IF 2.6 ) Pub Date : 2023-08-04 , DOI: 10.1007/s11033-023-08631-x
Huiyan Liu 1 , Xiangjun Zhang 2 , Jianshe Li 1, 3, 4 , Guangdi Zhang 1, 3, 4 , Haitian Fang 1 , Yu Li 4
Affiliation  

背景

杏果具有很大的经济价值。在利用传统育种方法进行杏育种的过程中,我们从原品种(命名为U)中获得了较大的苗(命名为Us)。而且Us水果比U大,味道更好。因此,揭示其作用机制对于杏育种具有重要意义。

方法

本研究采用从头组装和转录组测序(RNA-Seq)技术筛选U和U在幼果期、中熟期和成熟果期三个发育阶段的差异表达基因(DEG)。

结果

结果显示,不同采样时间共有6753个DEG。“纤维素合酶(UDP形成)活性”和“纤维素合酶活性”是GO中丰富的关键GO术语,其中CESACSL家族发挥了关键作用。“光合作用-天线蛋白”和“植物激素信号转导”是候选途径,lhcalhcb、Aux/IAASAUR是主要调节因子。

结论

美国生长素信号通路活跃,其中Aux/IAASAUR是果实大小的关键调节因子。美国lhca和lhcb水平较低,可能表明对外源碳需求较低,但它们在成熟期有所增加,这可能是由于aux的作用,它保持了果实的生长。辅助和光合作用可能是美国水果外观形成的主要原因。有趣的是, CESACSL的较高表达证明Us比U更早进入硬化过程。提前的发育进度也可能是由于Aux的作用。





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更新日期:2023-08-04
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