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T4噬菌体引发体组装和引物合成的结构基础
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2023-07-20 , DOI: 10.1038/s41467-023-40106-2 Xiang Feng 1 , Michelle M Spiering 2 , Ruda de Luna Almeida Santos 1 , Stephen J Benkovic 2 , Huilin Li 1
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更新日期:2023-07-21
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2023-07-20 , DOI: 10.1038/s41467-023-40106-2 Xiang Feng 1 , Michelle M Spiering 2 , Ruda de Luna Almeida Santos 1 , Stephen J Benkovic 2 , Huilin Li 1
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T4 噬菌体 gp41 解旋酶和 gp61 引物酶组装成引发体,将 DNA 解旋与 RNA 引物合成耦合以进行 DNA 复制。引发体是如何组装的以及引物长度是如何定义的尚不清楚。在这里,我们报告了一系列 T4 引发体组装中间体的冷冻电镜结构。我们表明,单独的 gp41 是一个开放螺旋,单链 DNA 结合会引发大规模的剪刀状构象变化,驱动环闭合并激活解旋酶。解旋酶激活暴露出隐秘的疏水表面以招募 gp61 引物酶。引物酶以二分模式结合解旋酶,其中 N 端 Zn 结合结构域和 C 端 RNA 聚合酶结构域各自包含一个解旋酶相互作用基序,该基序与单独的 gp41 N 端发夹二聚体结合,从而组装解旋酶六聚体上有一个引物酶。我们的研究揭示了 T4 引发体组装过程并揭示了 RNA 引物合成机制。
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