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单层 DNA 折纸结构域的序列依赖性折叠
Nanoscale ( IF 5.8 ) Pub Date : 2023-07-11 , DOI: 10.1039/d3nr02537c
Sabrina Gambietz 1 , Lena J Stenke 1 , Barbara Saccà 1
Nanoscale ( IF 5.8 ) Pub Date : 2023-07-11 , DOI: 10.1039/d3nr02537c
Sabrina Gambietz 1 , Lena J Stenke 1 , Barbara Saccà 1
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目前的 DNA 折纸折叠模型可以解释组装过程的产量以及施加机械力时结构的异构化。然而，该序列在这种构象转变中的作用仍不清楚。在这项工作中，我们通过对具有相同设计但不同序列内容的三个折纸域进行系统热力学研究来解决这个问题。通过比较不同设置下域的热稳定性并测量平衡时异构化的程度（在全局和单分子水平上），我们提取了序列对折叠的贡献，并提出了异构体的热临界图合理化我们的发现。通过考虑初始折叠位点的拓扑和热依赖性特性，我们的数据有助于更深入地了解 DNA 折纸组装。虽然前者负责该过程的机械方面，但后者证明了观察到的序列依赖性构象偏好的合理性，这些偏好在简单的折纸结构中显得很明显，但在大型和更复杂的结构中通常仍未公开。
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更新日期：2023-07-11
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