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利用计算构建甲藻荧光素生物发光机制
The Journal of Physical Chemistry Letters ( IF 4.8 ) Pub Date : 2023-06-22 , DOI: 10.1021/acs.jpclett.3c01053 Gabriel S Phun 1 , Dmitrij Rappoport 1 , Filipp Furche 1 , Tammie R Gibson 2 , Sergei Tretiak 2, 3
The Journal of Physical Chemistry Letters ( IF 4.8 ) Pub Date : 2023-06-22 , DOI: 10.1021/acs.jpclett.3c01053 Gabriel S Phun 1 , Dmitrij Rappoport 1 , Filipp Furche 1 , Tammie R Gibson 2 , Sergei Tretiak 2, 3
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甲藻荧光素生物发光是独特的，因为它不依赖于脱羧作用，但与萤火虫、细菌和腔肠动物荧光素相比，人们对其了解甚少。在这里，我们通过计算研究可能的质子化状态、立体异构体、化学机制以及负责化学激发的生物发光中间体的动力学。使用半经验动力学、随时间变化的密度泛函理论静态计算和相关图，我们发现可能负责化学激发的中间体官能团是一个四元环，即二氧杂环丁醇，它会经历[2π + 2π] 环化反转并生物荧光团是裂解结构。模拟的发射光谱和荧光素酶依赖性吸收光谱与实验数据一致，支持我们提出的机制和生物荧光团。我们还计算了中间体的四种立体异构体的圆二色光谱，以指导未来区分它们的实验。
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更新日期：2023-06-22
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