合理设计含无碱基位点的 DNA 三链体以结合低纳摩尔解离常数小分子,Analytical Chemistry

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合理设计含无碱基位点的 DNA 三链体以结合低纳摩尔解离常数小分子
Analytical Chemistry ( IF 6.7 ) Pub Date : 2023-06-21 , DOI: 10.1021/acs.analchem.2c05777
Jian Liu ₁ , Tingting Jiang ₁ , Jiemin Zhao ₂ , Mingchun Liu ₁ , Fangfang Chen ₁ , Lixin Lin ₁ , Huawei He ₃ , Hua Zuo ₁ , Cheng Zhi Huang ₁ , Chengde Mao _{1,

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功能生物大分子的从头设计对广泛的基础科学和技术应用具有极大的意义，包括了解生命进化和生物大分子结构、开发新型催化剂、发明药物和探索高性能材料。然而，这是一项极具挑战性的任务，其成功率也非常有限。它需要深入了解生物大分子的一级序列、3D结构和功能之间的关系。在此，我们报告了一种合理的、从头设计的DNA适体，它可以高特异性和高亲和力结合三聚氰胺（解离常数K _d= 4.4 nM）。该适体本质上是一个 DNA 三链体，但包含一个与三聚氰胺结合的脱碱基位点。适体-配体识别涉及氢键、π-π堆积和静电相互作用。通过设计与鸟苷结合的适体，进一步测试了该策略。可以想象，这样一个合理的策略，随着进一步发展，将为设计功能性DNA分子提供一个通用框架。

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更新日期：2023-06-21

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