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鸟枪法宏基因组学对土耳其牛轮状病毒野外分离株的基因组表征
Archives of Virology ( IF 2.5 ) Pub Date : 2023-05-12 , DOI: 10.1007/s00705-023-05778-7 Emel Aksoy 1 , Ahmet Kürşat Azkur 1
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更新日期:2023-05-12
Archives of Virology ( IF 2.5 ) Pub Date : 2023-05-12 , DOI: 10.1007/s00705-023-05778-7 Emel Aksoy 1 , Ahmet Kürşat Azkur 1
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一种来自 Kirsehir 的牛轮状病毒 (BRV) 分离物是从一头腹泻的新生小牛的粪便中分离出来的,经过鉴定,并通过鸟枪法测序对其进行了测序。其基因型星座为G10-P[5]-I2-R2-C2-M2-A3-N2-T6-E2-H3。Kirsehir 分离株的结构基因和非结构基因 NSP1、NSP3 和 NSP4 在序列上与土耳其鉴定的 BRV 相似。然而,VP2、NSP2、NSP4 和 NSP5/6 显示出与来自不同动物宿主的轮状病毒的相似性。这些发现不仅扩大了我们目前对轮状病毒多样性的理解,而且有助于我们了解轮状病毒在国家和全球层面的进化,并加强了在土耳其对轮状病毒进行进一步研究的重要性。
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