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瘤胃微生物组内核心纤毛虫的代谢影响
The ISME Journal ( IF 10.8 ) Pub Date : 2023-05-11 , DOI: 10.1038/s41396-023-01407-y
Thea O Andersen 1 , Ianina Altshuler 1 , Arturo Vera-Ponce de León 2 , Juline M Walter 2 , Emily McGovern 3 , Kate Keogh 3 , Cécile Martin 4 , Laurence Bernard 4 , Diego P Morgavi 4 , Tansol Park 5, 6 , Zongjun Li 7 , Yu Jiang 7 , Jeffrey L Firkins 6 , Zhongtang Yu 6 , Torgeir R Hvidsten 2 , Sinead M Waters 3 , Milka Popova 4 , Magnus Ø Arntzen 2 , Live H Hagen 2 , Phillip B Pope 1, 2
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原生动物占瘤胃微生物群中微生物生物量的主要部分,其中内甲类(Entodiniomorphida)和黑鳃金龟(Vestibuliferida ))一直被观察到在不同遗传和地理范围的反刍动物宿主中占主导地位。尽管原生动物物种发挥着明显的核心作用,但它们对瘤胃功能的主要生物学和代谢贡献在体内仍然很大程度上未被描述。在这里,我们利用来自瘤胃液样本的以(元)基因组为中心的元蛋白质组,这些样本来自饲喂不同脂质和淀粉水平的牛和山羊的饮食,以详细说明原生动物在其微生物共生环境中占据的特定代谢生态位。居民。通过总蛋白质计数和无标记定量进行的初步蛋白质组估计强调了内甲类物种EntodiniumEpidinium以及黑鳃金龟Dasytricha等毛虫占瘤胃总蛋白质组的很大一部分。原虫代谢的蛋白质组学检测,例如氢化酶(DasytrichaIsotricha、Epidinium、Enoploplastron)、碳水化合物活性酶(Epidinium、Diplodinium、EnoploplastronPolyplastron)、微生物捕食(Entodinium)和挥发性脂肪酸产生(EntodiniumEpidinium))在高甲烷排放动物中观察到水平升高。尽管某些原生动物物种在消化淀粉方面享有盛誉,但出人意料的是,在喂食高淀粉饮食的低甲烷排放动物中,它们的检测率较低,而这些动物主要是产生丙酸/琥珀酸的细菌群体,怀疑它们对捕食具有抵抗力,无论宿主如何。最后,我们重申了我们在地理独立数据集中的上述观察结果,从而阐明了未充分研究的真核生物种群在瘤胃中的实质性代谢影响,对消化和甲烷代谢具有更大的影响。





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更新日期:2023-05-11
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