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三链 DNA 作为 DNA 折纸中的结构元素
ACS Nano ( IF 15.8 ) Pub Date : 2023-05-09 , DOI: 10.1021/acsnano.2c11402 Ken Sachenbacher 1 , Ali Khoshouei 1 , Maximilian Nicolas Honemann 1 , Wouter Engelen 1 , Elija Feigl 1 , Hendrik Dietz 1
ACS Nano ( IF 15.8 ) Pub Date : 2023-05-09 , DOI: 10.1021/acsnano.2c11402 Ken Sachenbacher 1 , Ali Khoshouei 1 , Maximilian Nicolas Honemann 1 , Wouter Engelen 1 , Elija Feigl 1 , Hendrik Dietz 1
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分子自组装与 DNA 折纸提供了一种有吸引力的途径来制造任意三维纳米结构。在 DNA 折纸中,B 型双螺旋 DNA 结构域 (dsDNA) 通常与共价磷酸二酯链交叉连接以构建三维物体。为了扩展 DNA 折纸中结构基序的调色板,我们在这里将混合双链体-三链体 DNA 基序描述为 DNA 折纸中的 pH 依赖性构建块。我们研究了在多层 DNA 折纸对象中加入三链体形成寡核苷酸和非规范双链体-三链体交叉的设计规则。我们使用单粒子冷冻电子显微镜来阐明三重结构域和双重-三重交叉的结构基础。我们发现双工-三重交叉可以补充并完全取代 DNA 折纸对象中的规范双工-双工交叉,例如,增加交叉密度以获得更大的刚性和减少螺旋间距,并在传统交叉可能的位置创建连接不受欢迎。我们还展示了 pH 诱导的 DNA 折纸物体的形成完全由三重介导的链交叉稳定。
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更新日期:2023-05-09
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