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使用合成 sRNA 在不同细菌中进行靶向和高通量基因敲除
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2023-04-24 , DOI: 10.1038/s41467-023-38119-y
Jae Sung Cho 1, 2, 3 , Dongsoo Yang 1, 2, 4 , Cindy Pricilia Surya Prabowo 1, 2 , Mohammad Rifqi Ghiffary 2, 5 , Taehee Han 1, 2 , Kyeong Rok Choi 1, 2 , Cheon Woo Moon 1, 2 , Hengrui Zhou 1, 2 , Jae Yong Ryu 1, 2, 6 , Hyun Uk Kim 2, 5, 7 , Sang Yup Lee 1, 2, 7
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合成 sRNA 允许在翻译水平上敲低目标基因,但仅限于有限数量的细菌。在这里,我们报告了使用 RoxS 支架和来自枯草芽孢杆菌的 Hfq 伴侣的广泛宿主范围合成 sRNA (BHR-sRNA) 平台的开发。BHR-sRNA 在 16 种细菌中进行了测试,包括共生菌、益生菌、致病菌和工业细菌,在 12 种细菌中实现了 >50% 的目标基因敲低。对于医学应用,表皮葡萄球菌肺炎克雷伯菌中的毒力因子被敲低以减轻其毒力相关表型。对于代谢工程应用,高性能谷氨酸棒杆菌能够生产戊内酰胺(大宗化学品)和邻氨基苯甲酸甲酯(精细化学品)的菌株是通过目标基因的组合敲低开发的。构建了一个涵盖 2959 个谷氨酸棒杆菌基因的基因组规模 sRNA 文库, 用于靛蓝(天然着色剂)过度生产者的高通量比色筛选。BHR-sRNA 平台将加快对具有工业和医学意义的多种细菌进行工程改造。





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更新日期:2023-04-25
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