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运动质体 DNA 网络的单分子结构和拓扑
Physical Review X ( IF 11.6 ) Pub Date : 2023-04-19 , DOI: 10.1103/physrevx.13.021010
Pinyao He , Allard J. Katan , Luca Tubiana , Cees Dekker , Davide Michieletto
Physical Review X ( IF 11.6 ) Pub Date : 2023-04-19 , DOI: 10.1103/physrevx.13.021010
Pinyao He , Allard J. Katan , Luca Tubiana , Cees Dekker , Davide Michieletto
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Kinetoplast DNA (kDNA) 是一种二维奥林匹克环状网络,由相互连接的 DNA 小环组成,存在于某些称为锥虫的寄生虫中。了解这种结构的自组装和复制不仅是生物学中的主要开放问题,而且还可以为合成拓扑材料的设计提供信息。在这里,我们报告了第一个使用 AFM 和操纵分子动力学模拟的 kDNA 网络拓扑的高分辨率单分子研究。我们绘制出网络内的 DNA 密度以及连接数和小环化合价的分布。我们还描述了围绕网络的 DNA 中枢,并表明它们会导致类似于块状 2D 弹性热片的屈曲转变。有趣的是,我们观察到小环的密度和化合价分布广泛,表明不同kDNA结构的异构网络结构和个体主义。最后,我们估计网络的二维杨氏模量比其他二维材料小几个数量级。我们的发现解释了该领域的突出问题,并提供了对独特拓扑材料特性的单分子见解。
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更新日期:2023-04-19

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