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异头异构和糖苷键对多糖力学的控制
Journal of Chemical Sciences ( IF 1.7 ) Pub Date : 2023-04-06 , DOI: 10.1007/s12039-023-02141-w
Sruthi Peesapati , Durba Roy

多糖的力学,最多样化的生物分子,在这项工作中探索了各种带有α-β -D-吡喃葡萄糖残基并通过不同糖苷键连接的链。目的是了解单体的糖苷键类型和异聚性对多糖弹性的影响程度。我们使用受控分子动力学 (SMD) 模拟来了解拉应力下的机械应变。将由此生成的力延伸 (FE) 曲线与原子力显微镜 (AFM) 的结果进行比较以进行验证。与预期一致,我们的 SMD 结果表明,一般而言,α D-吡喃葡萄糖苷显示出从最稳定的4 C的构象转换1把椅子变成半椅或信封,在某些情况下甚至变成斜船或船形。然而,β 系列显示出最小的变形,但 β D-1-2 多糖除外,显示出一些转变。1-6 连接多糖的特殊情况及其由于在糖苷键中存在额外的 –CH 2基团而产生的额外弹性也很明显。一般来说,在所有研究的多糖中,α当暴露于 ~ 2100 pN 的拉应力时,D-1-6 吡喃葡萄糖苷每个环的最大弹性为 ~ 37%。密度泛函理论 (DFT) 计算有助于估计构象异构体的单点能量,因为多糖在 SMD 模拟中伸展。从这项工作中获得的对多糖力学的比较理解,将为创新的基于多糖的膜的建模和模拟奠定基础。





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更新日期:2023-04-08
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