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鉴定 CCL20 作为脑出血发病机制中炎症反应的关键生物标志物
Inflammation ( IF 4.5 ) Pub Date : 2023-03-20 , DOI: 10.1007/s10753-023-01807-4
Zong-Qing Zheng 1 , Gui-Qiang Yuan 2 , Guo-Guo Zhang 1 , Yan-Ting Chen 3 , Qian-Qian Nie 3 , Zhong Wang 1
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更新日期:2023-03-20
Inflammation ( IF 4.5 ) Pub Date : 2023-03-20 , DOI: 10.1007/s10753-023-01807-4
Zong-Qing Zheng 1 , Gui-Qiang Yuan 2 , Guo-Guo Zhang 1 , Yan-Ting Chen 3 , Qian-Qian Nie 3 , Zhong Wang 1
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脑出血(ICH)后的炎症反应会导致严重的继发性脑损伤,导致临床结果不佳。然而,对 ICH 进行有效抗炎治疗的相关基因仍不清楚。通过在线GEO2R探索人类ICH的差异表达基因(DEG)。Go和KEGG用于探索DEG的生物学功能。蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)建立在 String 数据库中。PPI 的关键模块通过分子复合物检测算法 (MCODE) 进行识别。Cytohubba 用于确定枢纽基因。mRNA-miRNA 相互作用网络是在 miRWalk 数据库中构建的。应用大鼠ICH模型来验证关键基因。ICH 中总共鉴定出 776 个 DEG。Go和KEGG分析表明DEGs主要参与中性粒细胞激活和TNF信号通路。GSEA 分析表明 DEG 在 TNF 信号传导和炎症反应中显着富集。在48个差异表达的炎症反应相关基因中构建PPI网络。PPI网络的关键模块由7个MCODE基因构建,起到炎症反应的作用。确定了 ICH 后炎症反应中程度最高的前 10 个枢纽基因。CCL20被证实是一个关键基因,主要在大鼠ICH模型的神经元中表达。建立了 CCL20 和 miR-766 之间的调控网络,并在人类 ICH 数据集中证实了 miR-766 的减少。CCL20是脑出血后炎症反应的关键生物标志物,为脑出血炎症干预提供了潜在靶点。

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