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肌醇三/四磷酸激酶 (ITPK) 家族的多样化:异常值 AtITPK4 的晶体结构和酶学
Biochemical Journal ( IF 4.4 ) Pub Date : 2023-03-29 , DOI: 10.1042/bcj20220579
Whitfield, Hayley L., He, Sining, Gu, Yinghong, Sprigg, Colleen, Kuo, Hui-Fen, Chiou, Tzyy-Jen, Riley, Andrew M., Potter, Barry V.L., Hemmings, Andrew M., Brearley, Charles A.
Biochemical Journal ( IF 4.4 ) Pub Date : 2023-03-29 , DOI: 10.1042/bcj20220579
Whitfield, Hayley L., He, Sining, Gu, Yinghong, Sprigg, Colleen, Kuo, Hui-Fen, Chiou, Tzyy-Jen, Riley, Andrew M., Potter, Barry V.L., Hemmings, Andrew M., Brearley, Charles A.
肌醇三/四磷酸激酶 (ITPK) 催化与肌醇磷酸和肌醇焦磷酸底物的多种磷酸转移反应。然而,缺乏核苷酸协调的植物 ITPK 结构阻碍了对该家族磷酸转移反应的理性理解。拟南芥拥有一个由四个 ITPK 组成的家族,其中两个亚型 ITPK1 和 ITPK4 直接或通过提供前体控制肌醇六磷酸和肌醇焦磷酸水平。在这里,我们描述了拟南芥 ITPK4 对不同肌醇多磷酸对映异构体的特异性,并展示了底物特异性与拟南芥 ITPK1 的不同之处。此外,我们提供了 2.11 Å 分辨率下 ATP 配位 AtITPK4 晶体结构的描述,连同对酶的对映体特异性的描述,为这种酶的不同磷酸转移酶活性提供了分子解释。拟南芥 ITPK4 对 ATP 的 KM 在几十微摩尔范围内,这可能解释了尽管 Atitpk4 突变体中 InsP6、InsP7 和 InsP8 合成被大规模取消,但 Atitpk4 缺乏 Atitpk1 突变体的磷酸盐饥饿反应。我们进一步证明拟南芥 ITPK4 及其在其他植物中的同系物具有 N-末端卤代酸脱卤素酶样折叠,之前没有描述过。揭示的结构和酶学信息将指导阐明 ITPK4 在不同生理背景下的功能,包括植物生物学的 InsP8 依赖性方面。拟南芥 ITPK4 对 ATP 的 KM 在几十微摩尔范围内,这可能解释了尽管 Atitpk4 突变体中 InsP6、InsP7 和 InsP8 合成被大规模取消,但 Atitpk4 缺乏 Atitpk1 突变体的磷酸盐饥饿反应。我们进一步证明拟南芥 ITPK4 及其在其他植物中的同系物具有 N-末端卤代酸脱卤素酶样折叠,之前没有描述过。揭示的结构和酶学信息将指导阐明 ITPK4 在不同生理背景下的功能,包括植物生物学的 InsP8 依赖性方面。拟南芥 ITPK4 对 ATP 的 KM 在几十微摩尔范围内,这可能解释了尽管 Atitpk4 突变体中 InsP6、InsP7 和 InsP8 合成被大规模取消,但 Atitpk4 缺乏 Atitpk1 突变体的磷酸盐饥饿反应。我们进一步证明拟南芥 ITPK4 及其在其他植物中的同系物具有 N-末端卤代酸脱卤素酶样折叠,之前没有描述过。揭示的结构和酶学信息将指导阐明 ITPK4 在不同生理背景下的功能,包括植物生物学的 InsP8 依赖性方面。我们进一步证明拟南芥 ITPK4 及其在其他植物中的同系物具有 N-末端卤代酸脱卤素酶样折叠,之前没有描述过。揭示的结构和酶学信息将指导阐明 ITPK4 在不同生理背景下的功能,包括植物生物学的 InsP8 依赖性方面。我们进一步证明拟南芥 ITPK4 及其在其他植物中的同系物具有 N-末端卤代酸脱卤素酶样折叠,之前没有描述过。揭示的结构和酶学信息将指导阐明 ITPK4 在不同生理背景下的功能,包括植物生物学的 InsP8 依赖性方面。
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更新日期:2023-04-03

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