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5-(取代亚苄基)嘧啶-2,4,6-三酮的合成、生化表征和分子模型研究:碱性磷酸酶的潜在抑制剂
Journal of Molecular Structure ( IF 4.0 ) Pub Date : 2023-02-23 , DOI: 10.1016/j.molstruc.2023.135225
Syeda Abida Ejaz , Muhammad Zain-ul-Abideen , Pervaiz Ali Channar , Aamer Saeed , Aftab Ahmed , Mohammad saleh Katubi , Norah Salem Alsaiari , Qamar Abbas , Kholood A. Dahlous , Hussain Raza , Song Ja Kim , Muhammad Naeem Mustafa

在同源二聚体蛋白酶的几种形式中,碱性磷酸酶是主要的酶,在多种生物活性中起着关键作用,并负责从多种分子中去除磷酸盐。据报道,碱性磷酸酶在许多多因素疾病/综合征和癌症患者中的表达较高,这使其成为治疗研究的一个有趣目标。由于肠道碱性磷酸酶 (IAP) 和组织非特异性碱性磷酸酶 (TNAP) 之间存在实质性结构相似性,因此仅发现了少数选择性抑制剂。巴比妥类药物是一类特殊的杂环化合物,具有作为有效磷酸酶抑制剂的潜力。在这种情况下,一系列新的 5-(取代亚苄基)嘧啶-2,4,6-三酮(3a-j)被设计出来并使用简单且环保的 Knovenagel 缩合工艺轻松合成。FT-IR、1 H-NMR 和13 C-NMR 用于表征合成的巴比妥酸盐。此外,还检查了这些化合物抑制小牛肠道碱性磷酸酶 (CIAP) 的能力。所有测试的化合物均显示出对 CIAP 的抑制作用,但化合物 5-(4-(二甲基氨基)亚苄基)嘧啶-2,4,6(1H,3H,5H)-trion (3f)被证明是最有效和最好的 CIAP抑制剂,IC 50值为 0.29±0.02 µM。为了测试它们在 CIAP 活性口袋内的稳定性和结合亲和力,进行了结构活性关系、分子对接研究和密度函数理论 (DFT) 计算。全局化学反应描述符通过 DFT 进行评估。对接研究表明,最活跃的抑制剂(3f)在肠道碱性磷酸酶的结合袋内表现出显着的相互作用。因此,筛选出的巴比妥类衍生物为后续开发碱性磷酸酶抑制剂提供了极好的平台。

设计了一系列新的 5-(取代亚苄基)嘧啶-2,4,6-三酮(3a-j),并使用简单且环保的 Knovenagel 缩合反应轻松合成。FT-IR、1 H-NMR/ 13 C-NMR用于表征合成的化合物。然后检查这些化合物抑制小牛肠碱性磷酸酶 (CIAP) 的能力。所有测试的化合物均显示出对 CIAP 的抑制作用,但化合物 5-(4-(Dimethylamino)benzylidene) pyrimidine-2,4,6(1H,3H,5H)-trion 3f 被证明是有效和最好的 CIAP 抑制剂, IC 50值为 0.29±0.02 µM。为了测试它们在 CIAP 靶位点活性口袋内的稳定性和结合亲和力,进行了构效关系、分子对接研究和密度函数理论计算。基于对接研究的结果,发现最有效的抑制剂3f在肠道碱性磷酸酶的结合口袋内具有强烈的相互作用。通过使用密度泛函计算评估全局化学反应性描述符。从体外和计算研究中,筛选出的巴比妥类衍生物被证明是后续研究和开发碱性磷酸酶抑制剂的合适基础。





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更新日期:2023-02-23
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