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利用生物信息学方法评价油籽蛋白作为抗菌肽前体的作用
Amino Acids ( IF 3.0 ) Pub Date : 2023-01-31 , DOI: 10.1007/s00726-023-03234-z Xiaojie Duan 1 , Yujia Leng 1 , Fusheng Chen 1 , Min Zhang 1 , Zihui Li 1
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在这项研究中,使用生物信息学方法评估了来自大豆、花生、芝麻、葵花籽和亚麻籽的油籽蛋白作为抗菌肽(AMP)前体的潜力。通过对 12 种油籽蛋白序列进行计算机水解,获得了 34 种新型潜在 AMP,其中 11 种在 CAMP R3的所有四种算法测试中均呈阳性。在分析的六种蛋白酶中,胰蛋白酶最有效地裂解大豆、花生、芝麻和葵花籽蛋白以产生 AMP,分别获得了 3、4、2 和 2 个 AMP。枯草杆菌蛋白酶对于亚麻籽 AMP 释放最有效,获得了三种 AMP。超过 85% 的 AMP 被预测为阳离子肽,并且一些 AMP 是疏水性的。这些潜在的 AMP 被归类为无毒肽,其中 15 种肽是非过敏性的。根据计算机模拟消化,所有 AMP 对消化酶都不稳定。本研究结果为利用油籽蛋白进一步开发AMPs提供了理论基础。
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