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二甲磺基丙酸 ABC 转运蛋白在丰富的海洋细菌中普遍存在
The ISME Journal ( IF 10.8 ) Pub Date : 2023-01-27 , DOI: 10.1038/s41396-023-01375-3
Chun-Yang Li 1, 2, 3 , Michaela A Mausz 4 , Andrew Murphy 4 , Nan Zhang 5 , Xiu-Lan Chen 2, 3 , Shu-Yan Wang 1 , Chao Gao 2 , María M Aguilo-Ferretjans 4 , Eleonora Silvano 4 , Ian D E A Lidbury 6 , Hui-Hui Fu 1 , Jonathan D Todd 7 , Yin Chen 1, 4 , Yu-Zhong Zhang 1, 2, 3
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二甲基磺酰基丙酸酯(DMSP)是海洋环境中普遍存在的有机硫化合物,在微生物和全球生物地球化学碳硫循环中具有重要作用。 SAR11 进化枝和海洋玫瑰杆菌群 (MRG) 代表地球表面海洋中异养细菌的两个主要类群,它们可以将 DMSP 积累到高毫摩尔细胞内浓度。然而,很少有研究调查SAR11和MRG细菌如何导入DMSP。在这里,通过比较基因组学分析、遗传操作和生化分析,我们在 MRG 的模型菌株Ruegeria pomeroyi DSS-3 中鉴定出了 ABC(ATP 结合盒)型 DMSP 特异性转运蛋白 DmpXWV。诱变表明 DmpXWV 是 DSS-3 菌株中负责 DMSP 摄取的关键转运蛋白。 DmpX是DmpXWV的底物结合蛋白,对DMSP具有高特异性和结合亲和力。此外,通过结构分析阐明了 DmpX DMSP 结合机制。 DmpX 蛋白普遍存在于 SAR11 进化枝和 MRG 之外的众多海洋细菌中,并且dmpX转录在地球的整个全球海洋中始终保持较高水平。因此,DmpXWV 可能使远洋海洋细菌能够有效地从海水中导入 DMSP。这项研究提供了对 DMSP 转运到海洋细菌中的新认识,并为海洋细菌的环境适应提供了新的见解。

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