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杏WRKY基因家族的鉴定及其对干旱胁迫的响应
Horticulture, Environment, and Biotechnology ( IF 2.5 ) Pub Date : 2023-01-20 , DOI: 10.1007/s13580-022-00465-z Chenjuan Jing , Duan Wang , Zhikun Liu , Xuefeng Chen , Hui Dong , Xiaohong Wu
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更新日期:2023-01-21
Horticulture, Environment, and Biotechnology ( IF 2.5 ) Pub Date : 2023-01-20 , DOI: 10.1007/s13580-022-00465-z Chenjuan Jing , Duan Wang , Zhikun Liu , Xuefeng Chen , Hui Dong , Xiaohong Wu
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WRKY家族已在14种植物中被发现,其成员多与植物抗逆性有关。杏树 ( Prunus armeniaca L.) 具有极强的耐旱性,但分子机制尚未阐明。因此,我们调查了杏中的 WRKY 基因家族,并分析了响应干旱胁迫的基因表达模式。在杏基因组中鉴定出总共 56 个候选 WRKY 基因 ( PaWRKY1–56 )。推定的蛋白质含有 162-1055 个氨基酸,等电点为 5.0-9.68,分子量为 18.76-114.2 Da。PaWRKY 家族有一个七肽结构域 (WRKY) 和锌指结构域 (CX 5-7 CX 22-23HXH),这显示了三组之间的差异变化。第 I 组有 12 个成员,2 个 WRKY 和锌指结构域分别位于 C 和 N 末端。Group II 可进一步分为 II-b、II-c、II-d 和 II-e,分别有 10、13、6 和 7 个成员。第三组有八名成员。II 组和 III 组的成员有一个 WRKY 和一个锌指结构域。五十一个 PaWRKY 基因不均匀地分布在八个连锁群中。仅检测到一个串联重复事件,基因复制被确定为驱动基因进化的主要因素。共有 28 个 PaWRKY 基因对干旱补液处理有反应。特别地,干旱胁迫上调PaWRKY11/14/48表达并下调PaWRKY23表达。PaWRKY 家族的全基因组鉴定、功能表征和进化分析为 WRKY 在杏树耐旱性中的作用提供了新的见解。
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