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对人类肠道细菌Eggerthella lenta的基因操作揭示了一个广泛的转录调节因子家族

Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2022-12-09 , DOI: 10.1038/s41467-022-33576-3
Xueyang Dong 1 , Ben G H Guthrie 2 , Margaret Alexander 2 , Cecilia Noecker 2 , Lorenzo Ramirez 2 , Nathaniel R Glasser 1 , Peter J Turnbaugh 2, 3 , Emily P Balskus 1, 4
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Eggerthella lenta是一种常见的人类肠道放线杆菌,与药物、膳食植物化学物质和胆汁酸代谢有关,并与多种人类疾病相关。目前还没有遗传工具可用于直接操纵迟缓E. lenta 。在这里,我们构建了穿梭载体并开发了转化E. lenta和其他 Coriobacteriia 的方法。借助这些工具,我们使用报告系统表征了内源E. lenta组成型和诱导型启动子,并构建了诱导型表达系统,从而实现了可调节的基因调控。我们还通过利用内源型 IC CRISPR-Cas 系统实现基因组编辑。利用这些工具进行基因敲除和互补,我们剖析了参与儿茶酚代谢的调节蛋白和酶的功能,揭示了一个以前未被重视的跨膜 LuxR 型转录调节因子家族。最后,我们利用我们的遗传工具箱来研究E. lenta基因对哺乳动物宿主生物学的影响。通过极大地扩展我们研究和改造肠道红细菌的能力,这些工具将揭示宿主-微生物相互作用的机制细节,并为其他未被充分研究的人类肠道细菌的基因操作提供路线图。





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更新日期:2022-12-10
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