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灵活的跨平台单细胞数据处理管道
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2022-11-11 , DOI: 10.1038/s41467-022-34681-z Kai Battenberg 1, 2 , S Thomas Kelly 1 , Radu Abu Ras 1, 3 , Nicola A Hetherington 4 , Makoto Hayashi 2 , Aki Minoda 1, 4
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更新日期：2022-11-11
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2022-11-11 , DOI: 10.1038/s41467-022-34681-z Kai Battenberg 1, 2 , S Thomas Kelly 1 , Radu Abu Ras 1, 3 , Nicola A Hetherington 4 , Makoto Hayashi 2 , Aki Minoda 1, 4
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用于量化单个细胞中 RNA 分子的单细胞 RNA 测序分析已经变得流行，因为它可以从每个实验中获得大量信息。我们推出 UniverSC (https://github.com/minoda-lab/universc)，这是一种通用的单细胞 RNA-seq 数据处理工具，支持任何基于独特分子标识符的平台。我们的命令行工具、docker 镜像和容器化图形应用程序可以对各种平台生成的数据进行一致且全面的集成、比较和评估。我们还提供了一个跨平台应用程序，通过图形用户界面运行 UniverSC，适用于 macOS、Windows 和 Linux Ubuntu，消除了单细胞 RNA-seq 分析的瓶颈之一，即为非生物信息学研究人员进行数据处理精通。
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