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DNA 条形码,一种有效的物种鉴定工具:综述
Molecular Biology Reports ( IF 2.6 ) Pub Date : 2022-10-29 , DOI: 10.1007/s11033-022-08015-7
Sandeep Antil 1 , Jeeva Susan Abraham 1 , S Sripoorna 1 , Swati Maurya 1 , Jyoti Dagar 1 , Seema Makhija 1 , Pooja Bhagat 1 , Renu Gupta 2 , Utkarsh Sood 3 , Rup Lal 3 , Ravi Toteja 1
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DNA 条形码是识别和发现物种的强大分类学工具。DNA 条形码利用一个或多个标准化的短 DNA 区域进行分类单元识别。随着新一代测序(NGS)、ONT MinION纳米孔测序和Pac Bio测序等新测序技术的出现,DNA条形码变得更加准确、快速和可靠。通过 DNA 条形码进行快速物种鉴定已用于多个领域,包括法医学、食品供应链控制和疾病认识。生命条形码联盟 (CBOL) 设立了多个工作组来识别通用条形码基因,例如后生动物中的 COI;植物中的 rbcL、matK 和 ITS;真菌中的 ITS;细菌和古细菌中的 16S rRNA 基因,并创建参考 DNA 条形码库。在这篇文章中,已尝试分析针对不同生物提出的各种 DNA 条形码、优势和局限性、DNA 条形码的最新进展以及加快 DNA 条形码参考库构建的方法。本研究得出结论,构建具有高物种覆盖率的参考库将是通过 DNA 条形码识别物种的重要一步。这可以通过使用先进的测序和数据分析方法在短时间内实现。





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更新日期:2022-10-29
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