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核酸内切酶 APE1 与 G-四链体 DNA 结合相互作用的二次谐波生成审讯
Analytical Chemistry ( IF 6.7 ) Pub Date : 2022-10-21 , DOI: 10.1021/acs.analchem.2c02951
Aaron M Fleming 1 , Renee Tran 1 , Carla A Omaga 1 , Shereen A Howpay Manage 1 , Cynthia J Burrows 1 , John C Conboy 1
Affiliation  

DNA 修复酶脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶-1 (APE1) 与带有脱碱基位点 (AP) 的启动子 G-四链体 (G4) 折叠之间的结合相互作用可作为氧化应激期间的基因调控开关。之前在溶液中基于荧光的分析表明 APE1 与VEGF启动子 G4结合,但这种相互作用是否具有特异性仍然是一个悬而未决的问题。二次谐波产生 (SHG) 在这项工作中用于测量非标记 DNA-蛋白质结合相互作用,具有高灵敏度,以证明相互作用是有序和特异性的。APE1 与VEGF的结合具有由四氢呋喃类似物模拟的 AP 位点的启动子 G4 产生的解离常数约为 100 nM,这与双链和单链 DNA 对照研究不同。SHG 测量证实 APE1以特定方式结合VEGF G4 折叠,解决了关于这种具有基因调节功能的核酸内切酶如何参与 G4 折叠的剩余问题。这些研究证明了 SHG 研究非经典 DNA-蛋白质相互作用的能力,为在未来的生化分析中使用这种分析方法提供了一个基础示例。



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更新日期:2022-10-21
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