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SMC 复合体可以穿越比其环尺寸更大的物理路障
Cell Reports ( IF 7.5 ) Pub Date : 2022-10-18 , DOI: 10.1016/j.celrep.2022.111491
Biswajit Pradhan 1 , Roman Barth 1 , Eugene Kim 1 , Iain F Davidson 2 , Benedikt Bauer 2 , Theo van Laar 3 , Wayne Yang 1 , Je-Kyung Ryu 1 , Jaco van der Torre 1 , Jan-Michael Peters 2 , Cees Dekker 1
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染色体 (SMC) 复合物(如凝聚素和粘着素)的环状结构维持会挤出 DNA 环。然而,尚不清楚它们如何在与蛋白质结合的染色质中挤出 DNA 环。在这里,我们使用体外单分子可视化显示核小体、RNA 聚合酶和 dCas9 对酵母凝聚素的环挤出几乎没有障碍。我们发现,即使是 200 nm 大的 DNA 结合纳米颗粒,远大于 SMC 环的大小,也会在凝聚素和凝聚素的挤压过程中转移到 DNA 环中。这甚至发生在单链形式的粘连蛋白中,其中成环亚基是共价连接的,不能打开以捕获 DNA。数据表明,SMC 驱动的循环挤压在将大障碍物融入循环方面几乎没有困难。研究结果还表明,挤出的 DNA 在拓扑上不通过 SMC 环(伪),因此指出了 DNA 环挤出的非拓扑机制。





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更新日期:2022-10-18
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