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士的宁的网络毒理学和分子对接分析表明 CHRM1 是一个潜在的神经毒性靶点
BMC Complementary and Alternative Medicine Pub Date : 2022-10-17 , DOI: 10.1186/s12906-022-03753-4 Jialin Dai , Jiangjin Liu , Maoxin Zhang , Yanni Yu , Jie Wang
BMC Complementary and Alternative Medicine Pub Date : 2022-10-17 , DOI: 10.1186/s12906-022-03753-4 Jialin Dai , Jiangjin Liu , Maoxin Zhang , Yanni Yu , Jie Wang
士的宁使用不当会导致死亡。本研究的目的是使用网络毒理学方法识别和评估与士的宁中活性化合物相关的毒性作用机制,并探索潜在的致病靶点。本研究利用中医系统药理学(TCMSP)数据库和四个疾病基因数据库(Genecards、OMIM、PharmGkb、TTD)建立士的宁靶点和中枢神经系统相关基因集。使用 Cytoscape 软件(版本 3.8.0)构建“成分-目标”交互式活动网络图。基于中心基因进行功能富集分析。使用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。使用 SwissADME 工具评估士的宁的药代动力学 (ADMET) 特性。使用 Autodock Vina 进行分子对接以探索活性化合物与靶蛋白之间的相互作用。获得了5个士的宁毒性相关成分和40个基因的基因组。GO和KEGG分析表明,士的宁通过G蛋白偶联受体信号通路作用于中枢神经系统。对“ADMET”相关参数的分析表明,(S)-stylopine 和异马钱子的胃肠道吸收率很高,并且这些化合物可以穿过血脑屏障。CHRM1被选为士的宁毒性的关键基因。分子对接结果表明共结晶配体不与CHRM1形成氢键。与其他两种化合物相比,(S)-stylopine 具有最高的结合亲和力(结合能 = - 8.5 kcal/mol)。网络毒理学和分子对接揭示了士的宁活性化合物的毒性机制。研究结果表明,CHRM1 是一个潜在的神经毒性靶标。(S)-stylopine 与其他配体相比表现出更强的神经毒性作用。
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更新日期:2022-10-17
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