当前位置：
X-MOL 学术
›
Nucleic Acids Res.
›
论文详情
Our official English website, www.x-mol.net, welcomes your
feedback! (Note: you will need to create a separate account there.)
G4Atlas：全面的全转录组 G-四联体数据库
Nucleic Acids Research ( IF 16.6 ) Pub Date : 2022-10-16 , DOI: 10.1093/nar/gkac896
Haopeng Yu 1 , Yiman Qi 1 , Bibo Yang 1 , Xiaofei Yang 1, 2, 3 , Yiliang Ding 1
Affiliation
RNA G-四联体 (rG4) 是重要的 RNA 三级结构基序，涉及鸟嘌呤 Hoogsteen 和 Watson-Crick 面上的碱基对。 rG4 在基因表达的转录后调控中非常重要。实验技术已经取得进步，可以在体外和体内鉴定不同转录组中的 rG4。基于这些最新进展，我们在这里推出了 G4Atlas，这是第一个转录组范围的 G-四联体数据库，在其中我们对通过 rG4-seq、化学分析和配体结合方法生成的转录组 rG4 实验数据进行了整理、分类和可视化。我们的综合数据库包括从 82 个实验处理和 10 个物种的 238 个样本生成的全转录组 rG4。此外，我们还包含了实验鉴定和未鉴定的 rG4 的 RNA 二级结构预测信息，使用户能够显示 rG4 和 RNA 二级结构之间任何潜在的竞争性折叠。因此，G4Atlas 将使用户能够探索 rG4 在不同生物过程中的一般功能。此外，G4Atlas 为进一步数据驱动的深度学习算法检查 rG4 结构特征奠定了基础。
"点击查看英文标题和摘要"
京公网安备 11010802027423号