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双残基新生链空间门控制 2′-O-甲基-和 2′-O-(2-甲氧基乙基)-RNA 的合成
Nature Chemistry ( IF 19.2 ) Pub Date : 2022-10-13 , DOI: 10.1038/s41557-022-01050-8 Niklas Freund 1 , Alexander I Taylor 1, 2 , Sebastian Arangundy-Franklin 1 , Nithya Subramanian 1 , Sew-Yeu Peak-Chew 1 , Amy M Whitaker 3, 4 , Bret D Freudenthal 3 , Mikhail Abramov 5 , Piet Herdewijn 5 , Philipp Holliger 1
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更新日期:2022-10-14
Nature Chemistry ( IF 19.2 ) Pub Date : 2022-10-13 , DOI: 10.1038/s41557-022-01050-8 Niklas Freund 1 , Alexander I Taylor 1, 2 , Sebastian Arangundy-Franklin 1 , Nithya Subramanian 1 , Sew-Yeu Peak-Chew 1 , Amy M Whitaker 3, 4 , Bret D Freudenthal 3 , Mikhail Abramov 5 , Piet Herdewijn 5 , Philipp Holliger 1
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空间排斥是酶底物特异性的关键要素,包括在聚合酶中。这种底物特异性限制了 2' 修饰核酸的酶促合成,这在基于核酸的药物开发中很重要。在这里,我们描述了古细菌 DNA 聚合酶中两个残基、新生链、空间控制“门”的发现。我们表明,在先前描述的 RNA 聚合酶活性的背景下,对门进行工程化以减少空间体积,从而解锁 2'-修饰的 RNA 寡聚物的合成,特别是限定序列和随机序列 2'- O -methyl- 的有效合成。 RNA (2'OMe-RNA) 和 2'- O-(2-甲氧基乙基)-RNA (MOE-RNA) 寡聚物高达 750 nt。这使得我们能够发现完全由 2'OMe-RNA (2'OMezymes) 组成的 RNA 核酸内切酶催化剂,用于致癌KRAS (G12D) 和 β-连环蛋白CTNNB1 (S33Y) mRNA的等位基因特异性切割,并详细阐述混合 2'OMe-RNA (2'OMezymes)。 OMe-/MOE-RNA 适体对血管内皮生长因子具有高亲和力。我们的研究结果为酶促合成以及定向进化和纳米技术领域的更广泛探索开辟了这些 2' 修饰 RNA(用于多种已批准的核酸疗法)。
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