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转录转移特征预测透明细胞肾细胞癌的生存
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2022-09-30 , DOI: 10.1038/s41467-022-33375-w
Adele M Alchahin 1 , Shenglin Mei 2 , Ioanna Tsea 1 , Taghreed Hirz 3, 4, 5 , Youmna Kfoury 3, 4, 5 , Douglas Dahl 6 , Chin-Lee Wu 7 , Alexander O Subtelny 7 , Shulin Wu 7 , David T Scadden 3, 4, 5 , John H Shin 8 , Philip J Saylor 9 , David B Sykes 3, 4, 5 , Peter V Kharchenko 2, 4, 10 , Ninib Baryawno 1, 3, 4, 5
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透明细胞肾细胞癌(ccRCC)是成人中最常见的肾癌类型。当 ccRCC 局限于肾脏时,手术切除或消融肿瘤通常可以治愈。然而,在转移情况下,ccRCC 仍然是一种高度致命的疾病。在这里,我们使用新鲜的患者样本,包括未经治疗的原发肿瘤组织、匹配的邻近正常肾组织,以及从骨转移患者收集的肿瘤样本。来自原发肿瘤的肿瘤细胞的单细胞转录组分析揭示了独特的转录特征,可以预测转移潜力和患者生存。对肿瘤环境内支持基质细胞的分析表明内皮细胞内的血管重塑。计算机细胞间相互作用分析强调CXCL9/CXCL10-CXCR3轴和CD70-CD27轴是潜在的治疗靶点。我们的研究结果为肿瘤细胞与 ccRCC 微环境之间的相互作用提供了生物学见解。
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