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单细胞 RNA 转录组学分析确定 Creb5 和 CD11b-DC 是哮喘恶化的调节剂
Mucosal Immunology ( IF 7.9 ) Pub Date : 2022-08-29 , DOI: 10.1038/s41385-022-00556-1
Xiaojie Liu 1 , Keilah G Netto 2 , Leon A Sokulsky 2 , Lujia Zhou 1 , Huisha Xu 1 , Chi Liu 3 , Ming Wang 4 , Huaqi Wang 5 , Hui Li 5 , Guojun Zhang 5 , Paul S Foster 2 , Fuguang Li 1 , Ming Yang 1, 2
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更新日期:2022-08-30
Mucosal Immunology ( IF 7.9 ) Pub Date : 2022-08-29 , DOI: 10.1038/s41385-022-00556-1
Xiaojie Liu 1 , Keilah G Netto 2 , Leon A Sokulsky 2 , Lujia Zhou 1 , Huisha Xu 1 , Chi Liu 3 , Ming Wang 4 , Huaqi Wang 5 , Hui Li 5 , Guojun Zhang 5 , Paul S Foster 2 , Fuguang Li 1 , Ming Yang 1, 2
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导致哮喘恶化的免疫反应与过敏原或病毒暴露有关。识别常见的免疫因子将有利于统一靶向治疗的发展。我们采用了屋尘螨 (HDM) 哮喘小鼠模型,并用过敏原(HDM、蟑螂提取物 (CRE))或呼吸道合胞病毒 (RSV) 对过敏性 HDM 小鼠进行了攻击。纯化的肺免疫细胞经过高维单细胞 RNA 深度测序 (scRNA-seq) 以生成 RNA 转录组。采用 siRNA 基因沉默来确认 scRNA-seq 分析的有效性。scRNA-seq UMAP 分析描绘了单个免疫簇内的一系列细胞标记。SCENIC R 分析显示 CD11b 中的调节子数量和活性增加-直流细胞。对保守调节子因子的分析进一步确定 Creb5 是恶化组之间的共享调节子。Creb5 siRNA 可减轻 HDM、CRE 或 RSV 诱导的哮喘恶化。免疫簇的 scRNA-seq 多维分析确定了在恶化组之间保守的基因通路。我们建议这些分析提供了一个强大的框架,可用于确定多方面病理学中的特定治疗靶点。

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