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FN1 编码纤连蛋白作为胰腺癌治疗干预的关键信号基因
Molecular Genetics and Genomics ( IF 2.3 ) Pub Date : 2022-08-18 , DOI: 10.1007/s00438-022-01943-w Gayathri Ashok 1, 2 , Sravan Kumar Miryala 1, 2 , Megha Treesa Saju 1, 2 , Anand Anbarasu 1, 3 , Sudha Ramaiah 1, 2
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胰腺癌的延迟诊断导致死亡率上升和生存率降低,而使用有效的治疗诊断生物标志物可以避免这种情况。由于检测延迟,治疗变得复杂,导致 5 年相对生存率降低。在我们目前的研究中,我们采用系统生物学方法来识别在肿瘤进展中发挥关键作用的中心基因。从各种数据库收集的胰腺癌基因被用来构建具有 812 个基因的具有统计显着性的相互作用组,并使用拓扑参数和功能富集分析对其进行进一步彻底分析。然后根据最大度参数识别网络中的重要基因。通过胰腺腺癌的风险比 [HR] 和基因表达 [log Fold Change] 表明的总体生存分析揭示了FN1 [HR 1.4;HR 1.4] 的关键作用。 log2(FC) 5.748], FGA [HR 0.78; log2(FC) 1.639] FGG [HR 0.9; log2(FC) 1.597], C3 [HR 1.1; log2(FC) 2.637] 和QSOX1 [HR 1.4; log2(FC) 2.371]。所鉴定的枢纽基因的功能意义意味着整合素细胞表面相互作用和蛋白聚糖多聚糖介导的细胞信号传导的丰富。 FN1基因的差异表达、低总生存率和功能意义暗示其可能在控制胰腺癌转移中发挥作用。此外, FN1基因的可变剪接变体显示出 10 个蛋白质编码转录物,具有保守的细胞附着位点和功能域,表明这些变体在胰腺癌中的潜在作用。 已确定的中心基因的强关联可以更好地指导设计转移性胰腺肿瘤的潜在治疗诊断生物标志物。
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