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一个新的长卫星 DNA 家族的鉴定和特征,特异于真正的蟾蜍(无尾蛇、两栖动物、蟾蜍科)
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2022-08-17 , DOI: 10.1038/s41598-022-18051-9
Katerina Guzmán 1 , Álvaro S Roco 1 , Matthias Stöck 2 , Adrián Ruiz-García 1 , Enrique García-Muñoz 3 , Mónica Bullejos 1
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在脊椎动物中,两栖动物的基因组大小变化最大。基因组大小变异归因于重复和非编码 DNA,包括卫星重复、转座因子、内含子以及病毒和细胞器 DNA 的核插入。在脊椎动物中,卫星 DNA 在哺乳动物中被广泛描述,但在两栖动物中进行的分子研究很少。在这里,我们提供了一个新的卫星 DNA 家族的详细特征,存在于蟾科的所有 15 个检查物种中。Southern blot分析和PCR表明,该卫星由807 bp的单体组成,串联排列,AT含量为57.4%。系统发育分析表明,大多数进化枝都表现出物种特异性差异,表明这种卫星 DNA 是通过协同进化进化而来的。BufoBufotes不显示物种特异性差异,而Rhinella marina的种群表现出种群特异性变化。此外,已在Duttaphrynus melanostictusR. marina中鉴定出该卫星 DNA 的变体,支持“文库假说”(一组卫星 DNA 的“文库”由一个物种组共享)。Bufo bufoBufo spinosusEpidalea calamitaBufotes viridis的物理图谱提供证据表明这种重复的 DNA 没有分散在核型中,而是积累在某些染色体对的着丝粒周围区域。这个位置,连同它在蟾蜍转录组中的存在,可能表明它在着丝粒功能或异染色质形成和维持中的作用。





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更新日期:2022-08-17
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