通过非编码 RNA 和表观转录组对缺氧进行分子调控,WIREs RNA

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通过非编码 RNA 和表观转录组对缺氧进行分子调控
WIREs RNA ( IF 6.4 ) Pub Date : 2022-07-03 , DOI: 10.1002/wrna.1750
Safirul Islam ₁ , Chandrama Mukherjee ₁

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细胞通过特定的细胞应激反应维持体内平衡以响应环境压力。众所周知，缺氧应激与多种实体瘤有关，是癌症相关死亡率的主要原因之一。尽管细胞在缺氧应激期间可以很好地自我平衡，但其潜在的分子机制尚不清楚。近年来，人们对非编码转录组和表观基因组发挥的多种作用的认识得到加强，揭示了非编码 RNA 和表观遗传修饰因子参与缺氧调节。深度测序等技术的出现促进了对在各种癌症中受到差异调控的大量长链非编码 RNA (lncRNA) 的鉴定。同样，蛋白质组学研究已经确定了多种表观遗传修饰因子，例如 HAT、HDAC、DNMT、多梳蛋白质组及其在缺氧调节中的可能作用。lncRNA 和表观遗传修饰剂之间的串扰在缺氧诱导的癌症发生和发展中起着关键作用。除了 lncRNA，其他几种非编码 RNA，如环状 RNA、miRNA 等也在缺氧条件下表达。缺氧对非编码 RNA 和表观遗传修饰因子的表达具有深远影响。相反，非编码 RNA/表观遗传修饰可以通过调节缺氧诱导因子 (HIF) 的稳定性来调节缺氧信号轴。这篇综述的重点是阐明缺氧生物学的分子编排，尤其是在癌症中，这有助于确定缺氧诱导的癌症中有希望的治疗靶点。以及它们在缺氧调节中的可能作用。lncRNA 和表观遗传修饰剂之间的串扰在缺氧诱导的癌症发生和发展中起着关键作用。除了 lncRNA，其他几种非编码 RNA，如环状 RNA、miRNA 等也在缺氧条件下表达。缺氧对非编码 RNA 和表观遗传修饰因子的表达具有深远影响。相反，非编码 RNA/表观遗传修饰可以通过调节缺氧诱导因子 (HIF) 的稳定性来调节缺氧信号轴。这篇综述的重点是阐明缺氧生物学的分子编排，尤其是在癌症中，这有助于确定缺氧诱导的癌症中有希望的治疗靶点。以及它们在缺氧调节中的可能作用。lncRNA 和表观遗传修饰剂之间的串扰在缺氧诱导的癌症发生和发展中起着关键作用。除了 lncRNA，其他几种非编码 RNA，如环状 RNA、miRNA 等也在缺氧条件下表达。缺氧对非编码 RNA 和表观遗传修饰因子的表达具有深远影响。相反，非编码 RNA/表观遗传修饰可以通过调节缺氧诱导因子 (HIF) 的稳定性来调节缺氧信号轴。这篇综述的重点是阐明缺氧生物学的分子编排，尤其是在癌症中，这有助于确定缺氧诱导的癌症中有希望的治疗靶点。lncRNA 和表观遗传修饰剂之间的串扰在缺氧诱导的癌症发生和发展中起着关键作用。除了 lncRNA，其他几种非编码 RNA，如环状 RNA、miRNA 等也在缺氧条件下表达。缺氧对非编码 RNA 和表观遗传修饰因子的表达具有深远影响。相反，非编码 RNA/表观遗传修饰可以通过调节缺氧诱导因子 (HIF) 的稳定性来调节缺氧信号轴。这篇综述的重点是阐明缺氧生物学的分子编排，尤其是在癌症中，这有助于确定缺氧诱导的癌症中有希望的治疗靶点。lncRNA 和表观遗传修饰剂之间的串扰在缺氧诱导的癌症发生和发展中起着关键作用。除了 lncRNA，其他几种非编码 RNA，如环状 RNA、miRNA 等也在缺氧条件下表达。缺氧对非编码 RNA 和表观遗传修饰因子的表达具有深远影响。相反，非编码 RNA/表观遗传修饰可以通过调节缺氧诱导因子 (HIF) 的稳定性来调节缺氧信号轴。这篇综述的重点是阐明缺氧生物学的分子编排，尤其是在癌症中，这有助于确定缺氧诱导的癌症中有希望的治疗靶点。其他几种非编码 RNA，如环状 RNA、miRNA 等，也在缺氧条件下表达。缺氧对非编码 RNA 和表观遗传修饰因子的表达具有深远影响。相反，非编码 RNA/表观遗传修饰可以通过调节缺氧诱导因子 (HIF) 的稳定性来调节缺氧信号轴。这篇综述的重点是阐明缺氧生物学的分子编排，尤其是在癌症中，这有助于确定缺氧诱导的癌症中有希望的治疗靶点。其他几种非编码 RNA，如环状 RNA、miRNA 等，也在缺氧条件下表达。缺氧对非编码 RNA 和表观遗传修饰因子的表达具有深远影响。相反，非编码 RNA/表观遗传修饰可以通过调节缺氧诱导因子 (HIF) 的稳定性来调节缺氧信号轴。这篇综述的重点是阐明缺氧生物学的分子编排，尤其是在癌症中，这有助于确定缺氧诱导的癌症中有希望的治疗靶点。非编码 RNA/表观遗传修饰可以通过调节缺氧诱导因子 (HIF) 的稳定性来调节缺氧信号轴。这篇综述的重点是阐明缺氧生物学的分子编排，尤其是在癌症中，这有助于确定缺氧诱导的癌症中有希望的治疗靶点。非编码 RNA/表观遗传修饰可以通过调节缺氧诱导因子 (HIF) 的稳定性来调节缺氧信号轴。这篇综述的重点是阐明缺氧生物学的分子编排，尤其是在癌症中，这有助于确定缺氧诱导的癌症中有希望的治疗靶点。

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Molecular regulation of hypoxia through the lenses of noncoding RNAs and epitranscriptome

Cells maintain homeostasis in response to environmental stress through specific cell stress responses. Hypoxic stress, well known to be associated with diverse solid tumors, is one of the main reasons for cancer-related mortality. Although cells can balance themselves well during hypoxic stress, the underlying molecular mechanisms are not well understood. The enhanced appreciation of diverse roles played by noncoding transcriptome and epigenome in recent years has brought to light the involvement of noncoding RNAs and epigenetic modifiers in hypoxic regulation. The emergence of techniques like deep sequencing has facilitated the identification of large numbers of long noncoding RNAs (lncRNAs) that are differentially regulated in various cancers. Similarly, proteomic studies have identified diverse epigenetic modifiers such as HATs, HDACs, DNMTs, polycomb groups of proteins, and their possible roles in the regulation of hypoxia. The crosstalk between lncRNAs and epigenetic modifiers play a pivotal role in hypoxia-induced cancer initiation and progression. Besides the lncRNAs, several other noncoding RNAs like circular RNAs, miRNAs, and so forth are also expressed during hypoxic conditions. Hypoxia has a profound effect on the expression of noncoding RNAs and epigenetic modifiers. Conversely, noncoding RNAs/epigenetic modifies can regulate the hypoxia signaling axis by modulating the stability of the hypoxia-inducible factors (HIFs). The focus of this review is to illustrate the molecular orchestration underlying hypoxia biology, especially in cancers, which can help in identifying promising therapeutic targets in hypoxia-induced cancers.

更新日期：2022-07-03

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