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番茄 (Solanum lycopersicum) 中的 STAY-GREEN (SGR) 基因:全基因组鉴定和表达分析揭示了它们在成熟和盐分胁迫反应中的作用
Horticulture, Environment, and Biotechnology ( IF 2.5 ) Pub Date : 2022-07-18 , DOI: 10.1007/s13580-022-00419-5
Selman Uluisik , Ali Kıyak , Fırat Kurt , Ertugrul Filiz

叶绿素 (Chl) 存在于许多植物器官中,在生长和发育过程中起着至关重要的作用。叶绿素的降解导致通常在衰老和果实成熟期间发生的绿色损失。本研究涉及番茄 ( Solanum lycopersicum )、SlSGR1 (Solyc08g080090.2.1) SlSGR2 (Solyc12g056480.1.1) 和SlSGR 样(Solyc04g063240.2.1) 基因的全基因组鉴定和生物信息学分析。多序列比对表明三种番茄 SGR 蛋白具有保守结构域。基序、序列和蛋白质结构分析表明,SlSGR-like 是从 SlSGR 蛋白差异进化而来的。对每个SlSGR进行共表达分析使用 Ailsa Craig (AC) 番茄品种的两个果实成熟阶段 [成熟绿色 (MG) 和成熟果实 (R)] 的转录组数据。根据共表达网络分析,SlSGRs参与了番茄成熟阶段的硫稳态、脂肪酸生物合成和植物发育的生物过程。在合并的共表达网络中鉴定了六个常见基因。此外,在共表达网络中搜索了 38 个转录因子家族 (TFF)。仅发现属于 7 个 TFF 的 13 个转录因子参与了这两个基因的调节。在这些 TFF 中,GRASGeBP在网络中有 5 个和 3 个SlSGR-likeSlSGR1成员。的表达谱SlSGR1/2SlSGR-like在不同组织和不同果实成熟阶段表明SlSGR1/2在成熟果实中高表达,而SlSGR-like更多地参与叶片成熟。此外, 200mM盐胁迫下'Ciko'和'Black'番茄品种叶片中SlSGR1/2SlSGR-like的表达表明SlSGR2发生了显着的表达变化,表明SlSGR基因可能参与了对非生物胁迫的信号反应。这些发现为这些基因在生长和盐胁迫中的功能提供了新的见解。





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更新日期:2022-07-19
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