Omicron SARS-CoV-2 与小鼠和棕榈果子狸 ACE2 的更广泛物种受体结合和结构基础,Cell Discovery

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Omicron SARS-CoV-2 与小鼠和棕榈果子狸 ACE2 的更广泛物种受体结合和结构基础
Cell Discovery ( IF 13.0 ) Pub Date : 2022-07-12 , DOI: 10.1038/s41421-022-00431-0
Linjie Li _{1,

2} , Pu Han ₁ , Baihan Huang ₁ , Yufeng Xie _{1,

3} , Weiwei Li _{1,

2} , Di Zhang _{1,

4} , Pengcheng Han _{1,

5} , Zepeng Xu _{1,

4} , Bin Bai _{1,

2} , Jingya Zhou _{1,

2} , Xinrui Kang _{1,

2} , Xiaomei Li ₆ , Anqi Zheng _{1,

2} , Rong Zhang _{1,

7} , Shitong Qiao _{1,

2} , Xin Zhao ₁ , Jianxun Qi _{1,

2} , Qihui Wang _{1,

2} , Kefang Liu ₁ , George Fu Gao _{1,

2}

Affiliation

SARS-CoV-2 的 Omicron 变体携带多个不寻常的突变，特别是在刺突 (S) 蛋白的受体结合域 (RBD) 中。此外，在Omicron RBD中还观察到493、498和501位残基等宿主适应性突变，这表明有必要评估Omicron变体的种间传播风险。在这里，我们评估了 27 个 ACE2 直系同源物（包括人类）对 Omicron BA.1 和 Delta RBD 的种间识别。我们发现 Omicron BA.1 将其受体结合谱扩展到棕榈果子狸、啮齿动物、更多的蝙蝠（最小的马蹄蝠和更大的马蹄蝠）和较小的刺猬tenrec。此外，我们确定了 Omicron BA 的低温电子显微镜 (cryo-EM) 结构。与小鼠 ACE2 (mACE2) 复合的 1 S 蛋白和与棕榈果子狸 ACE2 (cvACE2) 复合的 Omicron RBD 的晶体结构。已经确定了宿主范围的几个关键残基。这些结果表明，应加强对 Omicron 变体的监测，以监测其与更广泛物种的受体结合，以防止储存宿主的溢出和扩张，从而导致长期大流行。

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更新日期：2022-07-12

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