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磷酸戊糖途径对氧化应激反应的定量模型揭示了一种合作调节策略
iScience ( IF 4.6 ) Pub Date : 2022-06-28 , DOI: 10.1016/j.isci.2022.104681
Julien Hurbain 1 , Quentin Thommen 2 , Francois Anquez 1 , Benjamin Pfeuty 1
iScience ( IF 4.6 ) Pub Date : 2022-06-28 , DOI: 10.1016/j.isci.2022.104681
Julien Hurbain 1 , Quentin Thommen 2 , Francois Anquez 1 , Benjamin Pfeuty 1
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活细胞利用信号传导和调节机制来适应环境压力。对氧化应激的适应涉及糖酵解和磷酸戊糖途径 (PPP) 中许多酶的调节,从而支持 PPP 驱动的 NADPH 循环用于抗氧化防御。通过开发一种由人类成纤维细胞的代谢组学和 C-通量组学数据集驱动的动力学建模方法来研究潜在的调控逻辑。模型的贝叶斯参数估计和表型分析强调了几种代谢物酶调节的互补作用。具体来说,碳通量重新路由至 PPP 涉及伴随 NADPH/NADP 比率降低的 G6PD 活性上调与通过联合抑制 PGI 和 GAPD 酶对向下和向上糖酵解通量的差异控制之间的紧密协调。不同调节反馈之间的这种功能相互作用促进了在广泛的应激水平下的有效解毒和稳态反应,但也可以解释矛盾的微管表型,例如哺乳动物细胞中 6PGD 调节的报道。
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更新日期:2022-06-28

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