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揭示人类粘蛋白组
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2022-06-20 , DOI: 10.1038/s41467-022-31062-4 Stacy A Malaker 1, 2 , Nicholas M Riley 1 , D Judy Shon 1 , Kayvon Pedram 1 , Venkatesh Krishnan 3 , Oliver Dorigo 3 , Carolyn R Bertozzi 1, 4
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更新日期:2022-06-21
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2022-06-20 , DOI: 10.1038/s41467-022-31062-4 Stacy A Malaker 1, 2 , Nicholas M Riley 1 , D Judy Shon 1 , Kayvon Pedram 1 , Venkatesh Krishnan 3 , Oliver Dorigo 3 , Carolyn R Bertozzi 1, 4
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粘蛋白结构域是在各种细胞外和跨膜蛋白中发现的密集 O-糖基化模块化蛋白质结构域。粘蛋白结构域糖蛋白在许多人类疾病(例如癌症和囊性纤维化)中发挥着重要作用,但粘蛋白组的范围仍未明确界定。最近,我们对细菌 O-糖蛋白酶 StcE 进行了表征,并证明失活点突变体保留了对粘蛋白结构域糖蛋白的结合选择性。在这项工作中,我们利用非活性 StcE 从复杂样品(如细胞裂解物和粗卵巢癌患者腹水液)中选择性富集和鉴定粘蛋白结构域糖蛋白。我们的富集策略进一步得到了一种算法的帮助,该算法可以为粘蛋白结构域糖蛋白鉴定分配置信度。该粘蛋白组学平台有助于检测来自卵巢癌患者的粘蛋白结构域和高度重叠的粘蛋白结构域糖蛋白群体的数百种糖肽。最终,我们证明了我们的粘蛋白组学方法可以从体外和离体来源揭示癌症的关键分子特征。
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