从严重急性呼吸系统综合症 (SARS) 和中东呼吸系统综合症 (MERS) 爆发中获得的科学见解一直在帮助科学家和研究人员寻求针对严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 的抗病毒药物发现过程。冠状病毒和流感病毒都依赖宿主 2 型跨膜丝氨酸蛋白酶 TMPRSS2 进入和传播。最近的研究报告称，SARS-CoV-2 也使用 TMPRSS2 进入细胞。在目前的研究中，我们对从 zin 数据库下载的 1,82,651 种天然化合物进行基于结构的虚拟筛选，针对 TMPRSS2 蛋白的同源模型，然后进行基于分子动力学的模拟来识别潜在的 TMPRSS2 命中。虚拟筛选产生了 110 次命中，对接分数从 -8.654 到 -6 不等。775 和从 -55.714 到 -29.065 kcal/mol 的滑行能量。结合模式分析表明，命中分子与 TMPRSS2 活性位点残基形成 H 键、Pi-Pi 堆积和盐桥接触。前两个命中（ZINC000095912839 和 ZINC000085597504）的 MD 模拟显示与 TMPRSS2 形成稳定的复合物，RMSD 和 RMSF 波动最小。正如 Glide XP 对接所预测的，两种命中结构都与 Asp180、Gln183、Gly184、Ser186、Gly207 和 Gly209 强烈相互作用，并在 MD 模拟中与 Ser181 形成了显着的氢键相互作用。在这两个分子中，ZINC000095912839 与两个分子中的 TMPRSS2 具有最稳定的结合相互作用。本研究成功地从锌天然分子数据库中鉴定出 TMPRSS2 配体作为新型 SARs-CoV-2 治疗的潜在线索。065 千卡/摩尔。结合模式分析表明，命中分子与 TMPRSS2 活性位点残基形成 H 键、Pi-Pi 堆积和盐桥接触。前两个命中（ZINC000095912839 和 ZINC000085597504）的 MD 模拟显示与 TMPRSS2 形成稳定的复合物，RMSD 和 RMSF 波动最小。正如 Glide XP 对接所预测的，两种命中结构都与 Asp180、Gln183、Gly184、Ser186、Gly207 和 Gly209 强烈相互作用，并在 MD 模拟中与 Ser181 形成了显着的氢键相互作用。在这两个分子中，ZINC000095912839 与两个分子中的 TMPRSS2 具有最稳定的结合相互作用。本研究成功地从锌天然分子数据库中鉴定出 TMPRSS2 配体作为新型 SARs-CoV-2 治疗的潜在线索。065 千卡/摩尔。结合模式分析表明，命中分子与 TMPRSS2 活性位点残基形成 H 键、Pi-Pi 堆积和盐桥接触。前两个命中（ZINC000095912839 和 ZINC000085597504）的 MD 模拟显示与 TMPRSS2 形成稳定的复合物，RMSD 和 RMSF 波动最小。正如 Glide XP 对接所预测的，两种命中结构都与 Asp180、Gln183、Gly184、Ser186、Gly207 和 Gly209 强烈相互作用，并在 MD 模拟中与 Ser181 形成了显着的氢键相互作用。在这两个分子中，ZINC000095912839 与两个分子中的 TMPRSS2 具有最稳定的结合相互作用。本研究成功地从锌天然分子数据库中鉴定出 TMPRSS2 配体作为新型 SARs-CoV-2 治疗的潜在线索。结合模式分析表明，命中分子与 TMPRSS2 活性位点残基形成 H 键、Pi-Pi 堆积和盐桥接触。前两个命中（ZINC000095912839 和 ZINC000085597504）的 MD 模拟显示与 TMPRSS2 形成稳定的复合物，RMSD 和 RMSF 波动最小。正如 Glide XP 对接所预测的，两种命中结构都与 Asp180、Gln183、Gly184、Ser186、Gly207 和 Gly209 强烈相互作用，并在 MD 模拟中与 Ser181 形成了显着的氢键相互作用。在这两个分子中，ZINC000095912839 与两个分子中的 TMPRSS2 具有最稳定的结合相互作用。本研究成功地从锌天然分子数据库中鉴定出 TMPRSS2 配体作为新型 SARs-CoV-2 治疗的潜在线索。结合模式分析表明，命中分子与 TMPRSS2 活性位点残基形成 H 键、Pi-Pi 堆积和盐桥接触。前两个命中（ZINC000095912839 和 ZINC000085597504）的 MD 模拟显示与 TMPRSS2 形成稳定的复合物，RMSD 和 RMSF 波动最小。正如 Glide XP 对接所预测的，两种命中结构都与 Asp180、Gln183、Gly184、Ser186、Gly207 和 Gly209 强烈相互作用，并在 MD 模拟中与 Ser181 形成了显着的氢键相互作用。在这两个分子中，ZINC000095912839 与两个分子中的 TMPRSS2 具有最稳定的结合相互作用。本研究成功地从锌天然分子数据库中鉴定出 TMPRSS2 配体作为新型 SARs-CoV-2 治疗的潜在线索。Pi-Pi 堆积和盐桥与 TMPRSS2 活性位点残基接触。前两个命中（ZINC000095912839 和 ZINC000085597504）的 MD 模拟显示与 TMPRSS2 形成稳定的复合物，RMSD 和 RMSF 波动最小。正如 Glide XP 对接所预测的，两种命中结构都与 Asp180、Gln183、Gly184、Ser186、Gly207 和 Gly209 强烈相互作用，并在 MD 模拟中与 Ser181 形成了显着的氢键相互作用。在这两个分子中，ZINC000095912839 与两个分子中的 TMPRSS2 具有最稳定的结合相互作用。本研究成功地从锌天然分子数据库中鉴定出 TMPRSS2 配体作为新型 SARs-CoV-2 治疗的潜在线索。Pi-Pi 堆积和盐桥与 TMPRSS2 活性位点残基接触。前两个命中（ZINC000095912839 和 ZINC000085597504）的 MD 模拟显示与 TMPRSS2 形成稳定的复合物，RMSD 和 RMSF 波动最小。正如 Glide XP 对接所预测的，两种命中结构都与 Asp180、Gln183、Gly184、Ser186、Gly207 和 Gly209 强烈相互作用，并在 MD 模拟中与 Ser181 形成了显着的氢键相互作用。在这两个分子中，ZINC000095912839 与两个分子中的 TMPRSS2 具有最稳定的结合相互作用。本研究成功地从锌天然分子数据库中鉴定出 TMPRSS2 配体作为新型 SARs-CoV-2 治疗的潜在线索。前两个命中（ZINC000095912839 和 ZINC000085597504）的 MD 模拟显示与 TMPRSS2 形成稳定的复合物，RMSD 和 RMSF 波动最小。正如 Glide XP 对接所预测的，两种命中结构都与 Asp180、Gln183、Gly184、Ser186、Gly207 和 Gly209 强烈相互作用，并在 MD 模拟中与 Ser181 形成了显着的氢键相互作用。在这两个分子中，ZINC000095912839 与两个分子中的 TMPRSS2 具有最稳定的结合相互作用。本研究成功地从锌天然分子数据库中鉴定出 TMPRSS2 配体作为新型 SARs-CoV-2 治疗的潜在线索。前两个命中（ZINC000095912839 和 ZINC000085597504）的 MD 模拟显示与 TMPRSS2 形成稳定的复合物，RMSD 和 RMSF 波动最小。正如 Glide XP 对接所预测的，两种命中结构都与 Asp180、Gln183、Gly184、Ser186、Gly207 和 Gly209 强烈相互作用，并在 MD 模拟中与 Ser181 形成了显着的氢键相互作用。在这两个分子中，ZINC000095912839 与两个分子中的 TMPRSS2 具有最稳定的结合相互作用。本研究成功地从锌天然分子数据库中鉴定出 TMPRSS2 配体作为新型 SARs-CoV-2 治疗的潜在线索。并在 MD 模拟中与 Ser181 形成显着的氢键相互作用。在这两个分子中，ZINC000095912839 与两个分子中的 TMPRSS2 具有最稳定的结合相互作用。本研究成功地从锌天然分子数据库中鉴定出 TMPRSS2 配体作为新型 SARs-CoV-2 治疗的潜在线索。并在 MD 模拟中与 Ser181 形成显着的氢键相互作用。在这两个分子中，ZINC000095912839 与两个分子中的 TMPRSS2 具有最稳定的结合相互作用。本研究成功地从锌天然分子数据库中鉴定出 TMPRSS2 配体作为新型 SARs-CoV-2 治疗的潜在线索。