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N-甲基甲酰胺顺式和反式构象异构体在水、DMSO和不同组成的水-DMSO混合物中的氢键结构和动力学
Journal of Molecular Liquids ( IF 5.3 ) Pub Date : 2022-06-15 , DOI: 10.1016/j.molliq.2022.119610 Apramita Chand , Pragin Chettiyankandy , Rajesh Ghosh , Chinmay Parida , Snehasis Chowdhuri
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更新日期:2022-06-19
Journal of Molecular Liquids ( IF 5.3 ) Pub Date : 2022-06-15 , DOI: 10.1016/j.molliq.2022.119610 Apramita Chand , Pragin Chettiyankandy , Rajesh Ghosh , Chinmay Parida , Snehasis Chowdhuri
通过经典的分子动力学模拟研究了顺式和反式N-甲基甲酰胺 (NMF) 在水、DMSO 和水-DMSO 混合物中的局部氢键结构和动力学。我们已经考虑了五种不同浓度的 NMF 在水中以及 298 K 的 DMSO 中。对于水-DMSO 混合物中的 NMF (X NMF = 0.20),我们考虑了六种不同的浓度,从纯水中的 NMF 到亚甲基亚砜。可以观察到,与水的氧相比,NMF 的酰胺氢对 DMSO 的氧的供体能力更高。DMSO 的变化对 H NMF …O DMSO径向分布函数 (RDF) 的影响可以忽略不计,而 H NMF …OWAT随着向溶液中加入水而降低。对于水-DMSO 混合物中的 NMF,添加 DMSO 可增强 H NMF …O DMSO以及 H NMF …O WAT相关性,但它对溶液中顺式和反式NMF 的影响不同。DMSO 更喜欢顺式构象,而水更喜欢反式NMF。在 NMF-水-DMSO 混合物中,添加 DMSO 可将 H WAT …O NMF增强至中间 DMSO 浓度,但在非常高的 DMSO 浓度下,由于优选 H NMF …O DMSO ,它会降低相互作用。与 NMF-水相比,NMF-DMSO 溶液中 NMF-NMF 之间的氢键结合概率更高。在中等浓度的水-NMF 混合物中观察到所有物质的动态减慢,而在 NMF-DMSO 溶液的情况下,添加 DMSO 后观察到更快的动态。对于水-DMSO 混合物中的 NMF,当 DMSO 添加到 NMF-水溶液中时,观察到动态减速。我们计算的氢键寿命表明 DMSO 与顺式-NMF 形成更强的氢键,而水通常更喜欢反式-NMF。
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