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通过 RT-qPCR 在 28 点较大的马铃薯瓢虫中进行转录分析的参考基因选择
Journal of Asia-Pacific Entomology ( IF 1.1 ) Pub Date : 2022-03-04 , DOI: 10.1016/j.aspen.2022.101900
Yu-Xing Zhang 1 , Qiao Tan 1 , Chen-Hui Shen 1 , Jian-Jian Wu 1 , Yi-Kuan Wu 1 , Wen-ze Li 1 , Lin Jin 1 , Guo-Qing Li 1
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Henosepilachna vigintioctomaculata是攻击马铃薯的最严重的落叶之一。然而,由于缺乏有效和稳定的内源性参考来标准化 RT-qPCR 数据,对功能基因的研究受到了极大的限制。在本报告中,九个管家基因(RPL4RPL6RPL13RPL32RPS18ACTEF1αGAPDHα-TUB) 选择参与不同的生物过程。使用 RT-qPCR 技术确定它们在不同实验条件下的表达水平,包括发育阶段、组织、温度和宿主植物。基于五种替代稳定性分析方法(Ct值、geNorm、NormFinder、BestKeeper和ReFinder)对测试的候选基因进行综合排名。结果表明,最佳内参基因在不同的实验条件下存在差异。五个候选基因(RPL4、RPL13、RPL32、RPS18EF1α)中的任何一个基因对都是在不同温度和不同宿主植物上设置的合适的参考基因。RPL6RPL13的组合被推荐为跨不同发育阶段的最佳参考基因组。一对RPS18EF1α被列为不同组织内的最佳参考基因组合。在四种不同的实验条件下,最合适的参考基因是RPS18RPL13 。我们的研究结果不仅为RT-qPCR数据建立了准确可靠的标准化,而且为进一步研究H. vigintioctomaculata的功能基因奠定了坚实的基础。





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更新日期:2022-03-04
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