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SMAD4驱动的免疫特征的多组学景观和临床意义:对胰腺癌风险分层和一线治疗的意义
Computational and Structural Biotechnology Journal ( IF 4.4 ) Pub Date : 2022-03-02 , DOI: 10.1016/j.csbj.2022.02.031
Libo Wang 1, 2, 3 , Zaoqu Liu 4 , Rongtao Zhu 1, 2, 3 , Ruopeng Liang 1, 2, 3 , Weijie Wang 1, 2, 3 , Jian Li 1 , Yuyuan Zhang 4 , Chunguang Guo 5 , Xinwei Han 4 , Yuling Sun 1, 2, 3
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SMAD4突变最近与通过调节肿瘤免疫微环境促进胰腺癌 (PACA) 的侵袭和预后不良有关。然而,SMAD4驱动的免疫景观和临床意义仍然难以捉摸。在这项研究中,我们应用共识聚类和加权相关网络分析(WGCNA)来识别两种异质免疫亚型和免疫基因。结合由SMAD4突变状态确定的SMAD4驱动基因,一个SMAD4驱动免疫特征(SDIS)是通过机器学习算法在 ICGC-AU2(微阵列数据)中开发的,然后通过 RNA-seq 数据(TCGA、ICGC-AU 和 ICGC-CA)和微阵列数据(GSE62452 和 GSE85916)进行验证. 高危组预后较差,多变量 Cox 回归表明 SDIS 是独立的预后因素。在六个队列中,SDIS 在预测预后方面也表现出出色的准确性。此外,高风险组的特点是TP53 / CDKN2A突变和SMAD4的频率更高缺失,优越的免疫检查点分子表达,对化疗和免疫治疗更敏感。同时,低风险组显着丰富了代谢相关通路,并暗示了靶向肿瘤代谢以开发特定药物的潜力。总体而言,SDIS 可以有力地预测 PACA 的预后,这可能是一个有吸引力的平台,可以在临床环境中进一步定制化疗和免疫治疗的决策。





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更新日期:2022-03-02
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