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基于 Atg8–PE 蛋白的自噬研究体外生化方法
Autophagy ( IF 14.6 ) Pub Date : 2022-01-24 , DOI: 10.1080/15548627.2022.2025572
Xue Huang 1 , Jia Yao 1 , Lu Liu 1 , Yu Luo 1 , Aimin Yang 1
Affiliation  

摘要

巨自噬/自噬是一种进化上保守的细胞内降解途径,可维持细胞稳态。在过去的二十年里,一系列的科学突破帮助解释了自噬相关的分子机制和生理功能。这一巨大进步在很大程度上继续依赖于强大的研究方法,特别是各种基于自噬标记 Atg8-PE 蛋白的方法,用于研究膜动力学和监测自噬活性。最近,已经成功开发了几种生化方法来在体外生产脂化蛋白 Atg8-PE 或其模拟物,包括酶介导的重构系统、化学成分确定的重构系统、无细胞脂化系统和蛋白质化学合成。这些方法对 Atg8 介导的膜动力学和蛋白质-蛋白质相互作用的潜在机制提供了重要的见解,为自噬研究开辟了新的视角。在这篇综述中,我们全面总结了基于 Atg8–PE 蛋白的体外生化方法和最新进展,以促进更好地理解自噬机制。此外,我们强调了各种基于 Atg8–PE 蛋白的方法的优缺点,为它们在自噬研究中的应用提供了一般指导。

缩写: ATG:自噬相关;ATP:三磷酸腺苷;COPII:外壳蛋白复合物 II;DGS-NTA:1,2-二油-sn-甘油-3-[(N-(5-氨基-1-羧基戊基)亚氨基二乙酸)琥珀酰](镍盐);DPPE:1,2-二棕榈酰-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺;DSPE:1,2-二硬脂酰-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺;大肠杆菌:大肠杆菌; EPL:表达蛋白连接;ERGIC:ER-高尔基中间室;GABARAP:GABA A 型受体相关蛋白;GABARAPL1:GABA A 型受体相关蛋白 like 1;GABARAPL2:GABA A 型受体相关蛋白 2;GFP:绿色荧光蛋白;GUVs:巨大的单层囊泡;LIR:LC3相互作用区;MAP1LC3/LC3:微管相关蛋白 1 轻链 3;MBP:麦芽糖结合蛋白;MEFs:小鼠胚胎成纤维细胞;MESNa:2-巯基乙磺酸钠盐;NCL:天然化学连接;NTA:次氮基三乙酸;PE:磷脂酰乙醇胺;PS:磷脂酰丝氨酸;PtdIns3K:III 类磷脂酰肌醇 3-激酶;PtdIns3P:磷脂酰肌醇-3-磷酸;SPPS:固相肽合成;TEV:烟草蚀纹病毒;WT:野生型。





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更新日期:2022-01-24
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