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具有挑战性的条件下的合成 OCT 数据:三维 OCT 和异常的存在
Medical & Biological Engineering & Computing ( IF 2.6 ) Pub Date : 2021-11-18 , DOI: 10.1007/s11517-021-02469-w
Hajar Danesh 1 , Keivan Maghooli 1 , Alireza Dehghani 2 , Rahele Kafieh 3, 4
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更新日期:2021-11-19
Medical & Biological Engineering & Computing ( IF 2.6 ) Pub Date : 2021-11-18 , DOI: 10.1007/s11517-021-02469-w
Hajar Danesh 1 , Keivan Maghooli 1 , Alireza Dehghani 2 , Rahele Kafieh 3, 4
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如今,视网膜光学相干断层扫描 (OCT) 在眼科中发挥着重要作用,OCT 的自动分析非常重要:图像去噪有助于更好的诊断,而图像分割和分类在治疗评估中无疑是至关重要的。合成 OCT 最近被认为可以为自动算法的定量比较提供基准,并用于基于深度学习的新解决方案的训练阶段。由于视网膜 OCT 中的复杂数据结构,在存在异常的情况下,已经可以使用有限数量的描绘的 OCT 数据集;此外,OCT 的内在三维 (3D) 结构在许多公共 2D 数据集中被忽略。我们提出了一种新的合成方法,适用于 3D 数据,并且在存在糖尿病黄斑水肿 (DME) 等异常情况下是可行的。在这种方法中,在训练步骤中使用了有限数量的 OCT 数据,并且使用主动形状模型来生成合成 OCT 以及视网膜边界和异常位置的描绘。厚度图的统计比较表明,合成数据集可以用作原始数据集的统计可接受的代表(p > 0.05)。对合成血管的目视检查也很有希望。关于合成数据集的纹理特征,使用了 QQ 图,即使在点与直线略有偏离的情况下,Kolmogorov-Smirnov 检验的p值也拒绝了原假设,并显示出相同的纹理分布真实数据和合成数据的特征。所提出的算法为 OCT 增强方法的比较和定制的增强方法提供了一个独特的基准,以克服深度学习算法中 OCT 数量有限的问题。
图形概要

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