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铁死亡相关基因 AKR1C1 作为与免疫微环境和乳腺癌预后相关的新型生物标志物的评估
International Journal of General Medicine ( IF 2.1 ) Pub Date : 2021-09-28 , DOI: 10.2147/ijgm.s329031
Zeyu Zhang 1 , Xiangyuan Qiu 1 , Yuanliang Yan 2 , Qiujiu Liang 2 , Yuan Cai 3 , Bi Peng 3 , Zhijie Xu 3, 4 , Fada Xia 1
International Journal of General Medicine ( IF 2.1 ) Pub Date : 2021-09-28 , DOI: 10.2147/ijgm.s329031
Zeyu Zhang 1 , Xiangyuan Qiu 1 , Yuanliang Yan 2 , Qiujiu Liang 2 , Yuan Cai 3 , Bi Peng 3 , Zhijie Xu 3, 4 , Fada Xia 1
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背景: Ferroptosis 是最新发现的铁依赖性调节细胞死亡形式。人们越来越认识到,铁死亡相关基因参与了包括乳腺癌(BRCA)在内的癌症的发生和发展。因此,探索BRCA中铁死亡相关基因的生物功能具有重要意义。
方法:检索转录组微阵列数据集(GSE22358、GSE9014 和 GSE8977、GSE2990 和 GSE2034)和 TCGA- BRCA进行分析。并且使用了多种计算工具来识别BRCA中的作用和相关的生物学功能。
结果:两个铁死亡相关基因(AKR1C1和AKR1C3 ) 在 GSE22358、GSE9014 和 GSE8977 中显着表达。AKR1C1的高表达与良好的预后相关。TCGA- BRCA进一步证实了AKR1C1的表达和AKR1C1的预后价值。共表达分析显示最丰富的 GO 术语和 KEGG 通路是 DNA 模板转录和范可尼贫血通路的终止。随后,免疫学分析显示AKR1C1与各种免疫浸润细胞显着相关;其中,树突状细胞、中性粒细胞、巨噬细胞是浸润前三位的细胞。此外,AKR1C1还与多种免疫刺激分子和趋化因子相关,包括 PD-1、PD-L1、CTLA4、B7-H3、VSIR、IL-6、BTLA、CXCL2 和 CCR7。这些结果表明AKR1C1在乳腺癌发病过程中的免疫反应中的潜在作用。
结论:本研究首次证明铁死亡相关基因AKR1C1可能与免疫微环境相关,从而影响乳腺癌患者的发展和预后。
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更新日期:2021-09-28
方法:检索转录组微阵列数据集(GSE22358、GSE9014 和 GSE8977、GSE2990 和 GSE2034)和 TCGA- BRCA进行分析。并且使用了多种计算工具来识别BRCA中的作用和相关的生物学功能。
结果:两个铁死亡相关基因(AKR1C1和AKR1C3 ) 在 GSE22358、GSE9014 和 GSE8977 中显着表达。AKR1C1的高表达与良好的预后相关。TCGA- BRCA进一步证实了AKR1C1的表达和AKR1C1的预后价值。共表达分析显示最丰富的 GO 术语和 KEGG 通路是 DNA 模板转录和范可尼贫血通路的终止。随后,免疫学分析显示AKR1C1与各种免疫浸润细胞显着相关;其中,树突状细胞、中性粒细胞、巨噬细胞是浸润前三位的细胞。此外,AKR1C1还与多种免疫刺激分子和趋化因子相关,包括 PD-1、PD-L1、CTLA4、B7-H3、VSIR、IL-6、BTLA、CXCL2 和 CCR7。这些结果表明AKR1C1在乳腺癌发病过程中的免疫反应中的潜在作用。
结论:本研究首次证明铁死亡相关基因AKR1C1可能与免疫微环境相关,从而影响乳腺癌患者的发展和预后。

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