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酶促 Stetter 反应：MenD 反应机理的计算研究
ACS Catalysis ( IF 11.3 ) Pub Date : 2021-09-21 , DOI: 10.1021/acscatal.1c02292 Ferran Planas 1 , Michael J. McLeish 2 , Fahmi Himo 1
ACS Catalysis ( IF 11.3 ) Pub Date : 2021-09-21 , DOI: 10.1021/acscatal.1c02292 Ferran Planas 1 , Michael J. McLeish 2 , Fahmi Himo 1
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量子化学计算用于研究 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carb-acid (SEPHCHC) 合酶（也称为 MenD）的详细反应机理，这是一种硫胺二磷酸依赖性脱羧酶催化 2-酮戊二酸和异分支酸形成 SEPHCHC。该酶参与结核分枝杆菌的甲基萘醌生物合成途径并且被认为是抗结核治疗的潜在药物靶点。此外，MenD 显示出作为合成 1,4-官能化化合物的生物催化剂的前景。基于现有的X射线结构构建活性位点模型，优化和表征反应机理中涉及的中间体和过渡态。计算出的机制与先前的动力学研究非常一致，并为酶的作用模式提供了新的见解。特别讨论了在 X 射线结构中观察到的四面体脱羧后中间体的结构和作用。
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更新日期：2021-10-01
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