DNA靶上的三链体形成：如何选择寡核苷酸。,Biochemistry

当前位置： X-MOL 学术 › Biochemistry › 论文详情

Our official English website, www.x-mol.net, welcomes your feedback! (Note: you will need to create a separate account there.)

DNA靶上的三链体形成：如何选择寡核苷酸。
Biochemistry ( IF 2.9 ) Pub Date : 2008 Nov 25 , DOI: 10.1021/bi801087g
Pierre Vekhoff ₁ , Alexandre Ceccaldi ₁ , David Polverari ₁ , Jean Pylouster ₁ , Claudio Pisano ₁ , Paola B. Arimondo ₁

Affiliation

形成三链体的寡核苷酸（TFO）是序列特异性的DNA结合物。TFO提供了一种控制基因表达的工具，或者在连接到适当的化学试剂上时指导DNA损伤的工具。在这里，我们报告了一组规则，可通过考虑以下顺序来预测五个不同的三螺旋结合基序（TM，UM，GA，GT和GU，其中M为5-甲基脱氧胞苷，U为脱氧尿苷）中的最佳结合规则基础双链体靶标的组成。我们测试了具有致癌作用的基因中存在的11种不同的三聚体靶标。该规则具有预测力，在针对抗原应用的TFO设计中非常有用。简要地说，我们保留了基序GU和TM，当它们确实形成三元组时，含有G和U的TFO比含有T和M的TFO更可取。对于富含G的TFO，三重结构的形成主要取决于G的百分比和TFO的长度。在嘧啶基序的情况下，用U取代T会不稳定。三链体的形成取决于T的百分比，并且由于存在几个连续的M残基而不稳定。给出了在GU和TM图案之间选择的方程。

"点击查看英文标题和摘要"

更新日期：2017-01-31

点击分享查看原文

点击收藏

阅读更多本刊新发论文本刊介绍/投稿指南