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脂质双层中尼罗红的计算研究
Biophysical Journal ( IF 3.2 ) Pub Date : 2015-01-01 , DOI: 10.1016/j.bpj.2014.11.2551 Gurpreet Singh , Adam C. Chamberlin , Sergei Y. Noskov , D Peter Tieleman
Biophysical Journal ( IF 3.2 ) Pub Date : 2015-01-01 , DOI: 10.1016/j.bpj.2014.11.2551 Gurpreet Singh , Adam C. Chamberlin , Sergei Y. Noskov , D Peter Tieleman
染料 9-diethylamino-5H-benzo[α]phenoxazine-5-one，通常称为尼罗红，是一种荧光分子，其激发和发射最大值的位置取决于溶剂的极性。该染料主要用作确定脂质微环境的探针。在本演讲中，我们讨论了预测尼罗红在各种脂质双层环境中的光学位移的方法的开发。这种方法包括：1) 开发改进的尼罗红 MM 模型，2) 平均力 (PMF) 计算以确定双层中染料的方向和位置，3) 聚类以识别代表性配置和 4) 组合QM/MM 计算以预测双层中每个选定配置的尼罗红的光谱。
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更新日期：2015-01-01
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