2004年启动的植物蛋白质组学数据库（PPDB; http://ppdb.tc.cornell.edu）为通过实验鉴定拟南芥和玉米（玉米）中的蛋白质提供了集成资源。内部BLAST比对链接玉米和拟南芥信息。实验鉴定基于细胞类型特异性蛋白质组（玉米）或特定亚细胞蛋白质组（例如叶绿体，类囊体，核苷）和总叶蛋白质组样品（玉米和拟南芥）的内部质谱（MS）。迄今为止，已经在玉米和拟南芥中鉴定出超过5000个种质。此外，来自亚细胞区室或器官的80多个已发布的拟南芥蛋白质组数据集存储在PPDB中，并与每个基因座相关联。利用MS衍生的信息和文献，超过1500种拟南芥蛋白具有手动分配的亚细胞位置，尤其着重于质体蛋白。PPDB的其他新功能包括可检索的翻译后修饰和可检索的实验蛋白原型肽以及基于内部实验的每个鉴定出的种质的谱数信息。提供了各种搜索方法来为每个登录提取40多种数据类型，并为不同的功能类别或策展的亚细胞定位提取登录。每个登录的蛋白质报告页面提供全面的概述，包括预测的蛋白质特性，以及指向最相关数据库的超链接。PPDB的其他新功能包括可检索的翻译后修饰和可检索的实验蛋白原型肽以及基于内部实验的每个鉴定出的种质的谱数信息。提供了各种搜索方法来为每个登录提取40多种数据类型，并为不同的功能类别或策展的亚细胞定位提取登录。每个登录的蛋白质报告页面提供全面的概述，包括预测的蛋白质特性，以及指向最相关数据库的超链接。PPDB的其他新功能包括可检索的翻译后修饰和可检索的实验蛋白原型肽以及基于内部实验的每个鉴定出的种质的谱数信息。提供了各种搜索方法来为每个登录提取40多种数据类型，并为不同的功能类别或策展的亚细胞定位提取登录。每个登录的蛋白质报告页面提供全面的概述，包括预测的蛋白质特性，以及指向最相关数据库的超链接。提供了各种搜索方法来为每个登录提取40多种数据类型，并为不同的功能类别或选定的亚细胞定位提取登录。每个登录的蛋白质报告页面提供全面的概述，包括预测的蛋白质特性，以及指向最相关数据库的超链接。提供了各种搜索方法来为每个登录提取40多种数据类型，并为不同的功能类别或策展的亚细胞定位提取登录。每个登录的蛋白质报告页面提供全面的概述，包括预测的蛋白质特性，以及指向最相关数据库的超链接。



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