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Experimental and computational analysis of 1-(4-chloro-3-nitrophenyl)-3-(3,4-dichlorophenyl)thiourea
Journal of Molecular Structure ( IF 4.0 ) Pub Date : 2020-04-01 , DOI: 10.1016/j.molstruc.2019.127587
Anna Bielenica , Shargina Beegum , Y. Sheena Mary , Y. Shyma Mary , Renjith Thomas , Stevan Armaković , Sanja J. Armaković , Silvia Madeddu , Marta Struga , C. Van Alsenoy

Abstract This manuscript presents the computational and experimental studies of a new thiourea derivative 1-(4-chloro-3-nitrophenyl)-3-(3,4-dichlorophenyl)thiourea (CNDCT). Scaled simulated and experimental IR and Raman spectra were compared and the vibrational modes are assigned to proper vibrations followed by potential energy distribution study. Weakening of N-H bond is observed from the red shift in NH stretching mode values from the theoretical wavenumber values. Natural bond orbital studies provide the stability of the molecule and predict the change properties upon the charge delocalization. Reactive sites in the molecule were identified using molecular electrostatic potential figures. According to QTAIM analysis, the locations of noncovalent interactions in CNDCT-1 and CNDCT-3 are practically the same. The difference in case of the CNDCT-2 is that noncovalent interaction is formed between atoms N7-H30, instead between atoms O20-C12. Average Local Ionization Energy (ALIE) and Fukui functions provide information about the exact atoms susceptible to various attacks. The tendency of the molecule to undergo air autoxidation was found from the bond dissociation energies (BDE) values and the interaction of the molecules with solvent system was analyzed using and radial distribution functions (RDF) obtained from molecular dynamics (MD) simulations. NLO studies indicate that the candidate molecule is a good NLO material compared to that of urea. Docking studies reveal that the title compound shows the inhibitory activity against Farnesoid X receptor.

中文翻译:

1-(4-氯-3-硝基苯基)-3-(3,4-二氯苯基)硫脲的实验和计算分析

摘要 本手稿介绍了一种新的硫脲衍生物 1-(4-氯-3-硝基苯基)-3-(3,4-二氯苯基)硫脲 (CNDCT) 的计算和实验研究。比较了缩放的模拟和实验 IR 和拉曼光谱,并将振动模式分配给适当的振动,然后进行势能分布研究。从理论波数值的 NH 拉伸模式值的红移观察到 NH 键的弱化。自然键轨道研究提供了分子的稳定性并预测电荷离域后的变化特性。使用分子静电势图确定分子中的反应位点。根据 QTAIM 分析,CNDCT-1 和 CNDCT-3 中非共价相互作用的位置几乎相同。CNDCT-2 的不同之处在于原子 N7-H30 之间形成非共价相互作用,而不是原子 O20-C12 之间。平均局部电离能 (ALIE) 和 Fukui 函数提供有关易受各种攻击的确切原子的信息。从键解离能 (BDE) 值发现分子经历空气自动氧化的趋势,并使用从分子动力学 (MD) 模拟获得的径向分布函数 (RDF) 分析分子与溶剂系统的相互作用。NLO 研究表明,与尿素相比,候选分子是一种很好的 NLO 材料。对接研究表明,标题化合物显示出对法尼醇 X 受体的抑制活性。平均局部电离能 (ALIE) 和 Fukui 函数提供有关易受各种攻击的确切原子的信息。从键解离能 (BDE) 值发现分子经历空气自动氧化的趋势,并使用从分子动力学 (MD) 模拟获得的径向分布函数 (RDF) 分析分子与溶剂系统的相互作用。NLO 研究表明,与尿素相比,候选分子是一种很好的 NLO 材料。对接研究表明,标题化合物显示出对法尼醇 X 受体的抑制活性。平均局部电离能 (ALIE) 和 Fukui 函数提供有关易受各种攻击的确切原子的信息。从键解离能 (BDE) 值发现分子经历空气自动氧化的趋势,并使用从分子动力学 (MD) 模拟获得的径向分布函数 (RDF) 分析分子与溶剂系统的相互作用。NLO 研究表明,与尿素相比,候选分子是一种很好的 NLO 材料。对接研究表明,标题化合物显示出对法尼醇 X 受体的抑制活性。从键解离能 (BDE) 值发现分子经历空气自动氧化的趋势,并使用从分子动力学 (MD) 模拟获得的径向分布函数 (RDF) 分析分子与溶剂系统的相互作用。NLO 研究表明,与尿素相比,候选分子是一种很好的 NLO 材料。对接研究表明,标题化合物显示出对法尼醇 X 受体的抑制活性。从键解离能 (BDE) 值发现分子经历空气自动氧化的趋势,并使用从分子动力学 (MD) 模拟获得的径向分布函数 (RDF) 分析分子与溶剂系统的相互作用。NLO 研究表明,与尿素相比,候选分子是一种很好的 NLO 材料。对接研究表明,标题化合物显示出对法尼醇 X 受体的抑制活性。
更新日期:2020-04-01
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