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异香豆素的结构洞察、蛋白质-配体相互作用和光谱表征
Journal of Molecular Structure ( IF 4.0 ) Pub Date : 2017-04-01 , DOI: 10.1016/j.molstruc.2016.12.043 Anubha Srivastava , Harshita Singh , Rashmi Mishra , Kapil Dev , Poonam Tandon , Rakesh Maurya
Journal of Molecular Structure ( IF 4.0 ) Pub Date : 2017-04-01 , DOI: 10.1016/j.molstruc.2016.12.043 Anubha Srivastava , Harshita Singh , Rashmi Mishra , Kapil Dev , Poonam Tandon , Rakesh Maurya
摘要 Isoformononetin 是一种存在于药用植物中的甲氧基异黄酮,通过差异促分裂原活化蛋白激酶 (MAPK) 信号传导具有非雌激素骨形成作用。使用密度泛函理论 (DFT) 和 6-311++G(d,p) 作为大基组的光谱(FT-Raman、FT-IR、UV-vis 和 NMR 光谱)和量子化学计算已被用于研究异香豆素的结构和电子特性。进行详细的构象分析以确定构象异构体之间的稳定性和分子内氢键形成的各种可能性。用不同的蛋白激酶对异香豆素和之前研究过的异黄酮进行了分子对接研究,芒柄花素,以了解它们的抑制性质和官能团对成骨或骨质疏松相关蛋白的影响。发现甲氧基的氧原子、与苯环 R1、R3 相连的羟基和与吡喃环 R2 相连的羰基在与导致骨质疏松症的蛋白激酶结合中起主要作用;然而,在配体环和蛋白质之间没有观察到疏水相互作用。诸如 HOMO 和 LUMO 能量之类的电子特性是由时间相关的 TD-DFT 确定的,它预测构象 II 比异香豆素的构象 I 更稳定且化学反应性低。为了估计构效关系,分子静电势(MEP)表面图,和反应性描述符是根据分子的优化几何形状计算的。从这些结果中还发现,异芒柄花素在动力学上比芒柄花素更稳定、毒性更小、亲电子性弱且化学反应性更小。分子中的原子和自然键轨道分析用于详细分析分子内和分子间氢键相互作用。
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更新日期:2017-04-01
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