当前位置:
X-MOL 学术
›
Acta Pharm.
›
论文详情
Our official English website, www.x-mol.net, welcomes your
feedback! (Note: you will need to create a separate account there.)
3D-QSAR studies for the binding affinity toward (R, S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)-propionic acid receptor
Acta Pharmaceutica ( IF 2.1 ) Pub Date : 2008-09-01 , DOI: 10.2478/v10007-008-0020-5 Ritesh Sharma , Hardik Thakar , Kamala Vasu , Subhash Chaturvedi
Acta Pharmaceutica ( IF 2.1 ) Pub Date : 2008-09-01 , DOI: 10.2478/v10007-008-0020-5 Ritesh Sharma , Hardik Thakar , Kamala Vasu , Subhash Chaturvedi
3D-QSAR studies for the binding affinity toward (R, S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)-propionic acid receptor An approach for binding affinity evaluation is suggested and exemplified using a set of triazolo [1,5-a] quinoxaline for the (R, S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol--4-yl)-propionic acid (AMPA) receptor. Biological activity toward the AMPA receptor (expressed as --log IC50) was taken as a dependent variable for building Comparative Molecular Field Analysis (CoMFA) and Comparative Molecular Similarity Indices Analysis (CoMSIA) models. The resulting models show the ways of increasing the binding affinity to the AMPA receptor as a potential target for epilepsy. The statistically significant results show that the cross-validated r2CV value (0.766) for the CoMFA model is greater than (0.758) for the CoMSIA model. The non-cross validated run giving the coefficient of determination r2 values of 0.944 and 0.919 for CoMFA and CoMSIA, respectively, provided good correlation between the observed and computed affinities of the training set compounds. The resulting CoMFA and CoMSIA models indicate that steric, electrostatic, hydrophobic (lipophilic), hydrogen bond donor and acceptor substituents play a significant role in increasing the binding affinity and selectivity of the compounds toward the AMPA receptor. 3D-QSAR studija za afinitet vezanja na receptor za (R, S)-2-amino-3-(3-hidroksi-5-metilizoksazol-4-il)-propansku kiselinu U radu je vrednovan afinitet vezanja serije triazolo[1,5-a]kinoksalina na receptor za (R, S)-2-amino-3-(3-hidroksi-5-metilizoksazol-4-il)-propansku kiselinu (AMPA). Djelovanje na AMPA receptor (izraženo kao --log IC50) uzeta je kao zavisna varijabla u modelima usporedne analize molekulskih polja (Comparative Molecular Field Analysis, CoMFA) i usporedne analize molekulske sličnosti (Comparative Molecular Similarity Indices Analysis, CoMSIA). Ti modeli pokazuju kako povećati afinitet vezanja na AMPA receptor, što može biti korisno u terapiji epilepsije. Statistički značajni rezultati ukazuju da je križno validirana r2CV vrijednost za CoMFA model (0,766) veća nego za CoMSIA model (0,758). Koeficijenti r2 za CoMFA model (0,944) i CoMSIA (0,919) ukazuju na dobru korelaciju između izračunatih i eksperimentalno određanih afiniteta vezanja proučavane serije spojeva. Prema oba modela za povećanje afiniteta vezanja i selektivnost spojeva za AMPA receptor značajna su sterička, elektrostatska, hidrofobna (lipofilni) svojstva, te sposobnost stvaranja vodikovih veza.
中文翻译:
对 (R, S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)-丙酸受体的结合亲和力的 3D-QSAR 研究
3D-QSAR 研究对 (R, S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)-propionic acid 受体的结合亲和力一组用于 (R, S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol--4-yl)-propionic acid (AMPA) 受体的三唑并 [1,5-a] 喹喔啉。针对 AMPA 受体的生物活性(表示为 --log IC50)被视为构建比较分子场分析 (CoMFA) 和比较分子相似性指数分析 (CoMSIA) 模型的因变量。由此产生的模型显示了增加对作为癫痫潜在靶标的 AMPA 受体的结合亲和力的方法。统计显着性结果表明 CoMFA 模型的交叉验证 r2CV 值 (0.766) 大于 CoMSIA 模型的 (0.758)。非交叉验证的运行给出了 CoMFA 和 CoMSIA 的决定系数 r2 值分别为 0.944 和 0.919,提供了训练集化合物的观察和计算亲和力之间的良好相关性。所得的 CoMFA 和 CoMSIA 模型表明,空间、静电、疏水(亲脂)、氢键供体和受体取代基在增加化合物对 AMPA 受体的结合亲和力和选择性方面起着重要作用。3D-QSAR 研究 za afinitet vezanja na 受体 za (R, S)-2-amino-3-(3-hidroksi-5-metilizoksazol-4-il)-propansku kiselinu U radu je vrednovan afinitet vezanja serije triazolo[1,5 -a]kinoksalina na 受体 za (R, S)-2-amino-3-(3-hidroksi-5-metilizoksazol-4-il)-propansku kiselinu (AMPA)。Djelovanje na AMPA 受体 (izraženo kao --log IC50) uzeta je kao zavisna varijabla u modelima usporedne analize molekulskih polja(比较分子场分析,CoMFA) i usporedne 分析molekulske sličnosti(比较性分析)。Ti modeli pokazuju kako povećati afinitet vezanja na AMPA 受体,što može biti korisno u terapiji epilepsije。Statistički značajni rezultati ukazuju da je križno validirana r2CV vrijednost za CoMFA 模型 (0,766) veća nego za CoMSIA 模型 (0,758)。Koeficijenti r2 za CoMFA 模型 (0,944) i CoMSIA (0,919) ukazuju na dobru korelaciju između izračunatih i eksperimentalno određanih afiniteta vezanja proučavane serije spojeva。Prema oba modela za povećanje afiniteta vezanja i selektivnost spojeva za AMPA 受体 značajna su sterička, elektrostatska,
更新日期:2008-09-01
中文翻译:
对 (R, S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)-丙酸受体的结合亲和力的 3D-QSAR 研究
3D-QSAR 研究对 (R, S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)-propionic acid 受体的结合亲和力一组用于 (R, S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol--4-yl)-propionic acid (AMPA) 受体的三唑并 [1,5-a] 喹喔啉。针对 AMPA 受体的生物活性(表示为 --log IC50)被视为构建比较分子场分析 (CoMFA) 和比较分子相似性指数分析 (CoMSIA) 模型的因变量。由此产生的模型显示了增加对作为癫痫潜在靶标的 AMPA 受体的结合亲和力的方法。统计显着性结果表明 CoMFA 模型的交叉验证 r2CV 值 (0.766) 大于 CoMSIA 模型的 (0.758)。非交叉验证的运行给出了 CoMFA 和 CoMSIA 的决定系数 r2 值分别为 0.944 和 0.919,提供了训练集化合物的观察和计算亲和力之间的良好相关性。所得的 CoMFA 和 CoMSIA 模型表明,空间、静电、疏水(亲脂)、氢键供体和受体取代基在增加化合物对 AMPA 受体的结合亲和力和选择性方面起着重要作用。3D-QSAR 研究 za afinitet vezanja na 受体 za (R, S)-2-amino-3-(3-hidroksi-5-metilizoksazol-4-il)-propansku kiselinu U radu je vrednovan afinitet vezanja serije triazolo[1,5 -a]kinoksalina na 受体 za (R, S)-2-amino-3-(3-hidroksi-5-metilizoksazol-4-il)-propansku kiselinu (AMPA)。Djelovanje na AMPA 受体 (izraženo kao --log IC50) uzeta je kao zavisna varijabla u modelima usporedne analize molekulskih polja(比较分子场分析,CoMFA) i usporedne 分析molekulske sličnosti(比较性分析)。Ti modeli pokazuju kako povećati afinitet vezanja na AMPA 受体,što može biti korisno u terapiji epilepsije。Statistički značajni rezultati ukazuju da je križno validirana r2CV vrijednost za CoMFA 模型 (0,766) veća nego za CoMSIA 模型 (0,758)。Koeficijenti r2 za CoMFA 模型 (0,944) i CoMSIA (0,919) ukazuju na dobru korelaciju između izračunatih i eksperimentalno određanih afiniteta vezanja proučavane serije spojeva。Prema oba modela za povećanje afiniteta vezanja i selektivnost spojeva za AMPA 受体 značajna su sterička, elektrostatska,